Protein–RNA interactions for Protein: P56393

Cox7b, Cytochrome c oxidase subunit 7B, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 80 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cox7bP56393 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cox7bP56393 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cox7bP56393 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cox7bP56393 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cox7bP56393 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cox7bP56393 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cox7bP56393 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cox7bP56393 Mllt6-202ENSMUST00000107586 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cox7bP56393 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cox7bP56393 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cox7bP56393 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cox7bP56393 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cox7bP56393 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cox7bP56393 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Cox7bP56393 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cox7bP56393 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Cox7bP56393 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cox7bP56393 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cox7bP56393 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cox7bP56393 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cox7bP56393 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cox7bP56393 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cox7bP56393 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cox7bP56393 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cox7bP56393 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cox7bP56393 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cox7bP56393 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cox7bP56393 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cox7bP56393 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cox7bP56393 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cox7bP56393 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cox7bP56393 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cox7bP56393 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cox7bP56393 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cox7bP56393 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Cox7bP56393 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Cox7bP56393 Atp8a1-201ENSMUST00000037380 8178 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Cox7bP56393 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Cox7bP56393 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Cox7bP56393 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Cox7bP56393 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Cox7bP56393 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Cox7bP56393 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Cox7bP56393 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Cox7bP56393 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Cox7bP56393 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Cox7bP56393 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Cox7bP56393 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Cox7bP56393 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Cox7bP56393 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Cox7bP56393 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Cox7bP56393 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Cox7bP56393 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Cox7bP56393 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Cox7bP56393 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Cox7bP56393 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Cox7bP56393 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Cox7bP56393 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Cox7bP56393 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Cox7bP56393 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Cox7bP56393 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Cox7bP56393 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Cox7bP56393 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Cox7bP56393 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Cox7bP56393 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Cox7bP56393 Iqsec3-203ENSMUST00000151397 8067 ntTSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Cox7bP56393 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Cox7bP56393 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Cox7bP56393 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Cox7bP56393 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Cox7bP56393 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Cox7bP56393 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Cox7bP56393 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Cox7bP56393 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Cox7bP56393 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Cox7bP56393 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Cox7bP56393 Rnf152-202ENSMUST00000172299 8406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Cox7bP56393 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Cox7bP56393 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Cox7bP56393 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Cox7bP56393 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Cox7bP56393 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Cox7bP56393 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Cox7bP56393 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Cox7bP56393 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Cox7bP56393 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Cox7bP56393 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Cox7bP56393 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Cox7bP56393 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Cox7bP56393 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Cox7bP56393 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Cox7bP56393 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Cox7bP56393 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Cox7bP56393 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Cox7bP56393 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
Cox7bP56393 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Cox7bP56393 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Cox7bP56393 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Cox7bP56393 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Cox7bP56393 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.1 ms