Protein–RNA interactions for Protein: P54731

Faf1, FAS-associated factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 649 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Faf1P54731 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Faf1P54731 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Faf1P54731 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Faf1P54731 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Faf1P54731 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Faf1P54731 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Faf1P54731 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Faf1P54731 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Faf1P54731 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Faf1P54731 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Faf1P54731 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Faf1P54731 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Faf1P54731 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Faf1P54731 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Faf1P54731 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Faf1P54731 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Faf1P54731 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Faf1P54731 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Faf1P54731 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Faf1P54731 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Faf1P54731 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Faf1P54731 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Faf1P54731 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Faf1P54731 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Faf1P54731 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Faf1P54731 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Faf1P54731 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Faf1P54731 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Faf1P54731 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Faf1P54731 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Faf1P54731 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Faf1P54731 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Faf1P54731 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Faf1P54731 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Faf1P54731 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Faf1P54731 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Faf1P54731 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Faf1P54731 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Faf1P54731 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Faf1P54731 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Faf1P54731 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Faf1P54731 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Faf1P54731 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Faf1P54731 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Faf1P54731 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Faf1P54731 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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Faf1P54731 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Faf1P54731 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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Faf1P54731 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Faf1P54731 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Faf1P54731 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Faf1P54731 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Faf1P54731 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Faf1P54731 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Faf1P54731 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Faf1P54731 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Faf1P54731 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Faf1P54731 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Faf1P54731 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Faf1P54731 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Faf1P54731 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Faf1P54731 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
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Faf1P54731 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Faf1P54731 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Faf1P54731 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Faf1P54731 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Faf1P54731 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Faf1P54731 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Faf1P54731 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Faf1P54731 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Faf1P54731 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Faf1P54731 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Faf1P54731 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Faf1P54731 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Faf1P54731 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Faf1P54731 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Faf1P54731 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Faf1P54731 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Faf1P54731 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Faf1P54731 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Faf1P54731 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Faf1P54731 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Faf1P54731 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Faf1P54731 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Faf1P54731 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Faf1P54731 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Faf1P54731 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Faf1P54731 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Faf1P54731 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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