Protein–RNA interactions for Protein: P53996

Cnbp, Cellular nucleic acid-binding protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 178 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CnbpP53996 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
CnbpP53996 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
CnbpP53996 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
CnbpP53996 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
CnbpP53996 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
CnbpP53996 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
CnbpP53996 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
CnbpP53996 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
CnbpP53996 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
CnbpP53996 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
CnbpP53996 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
CnbpP53996 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
CnbpP53996 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
CnbpP53996 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
CnbpP53996 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
CnbpP53996 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
CnbpP53996 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
CnbpP53996 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
CnbpP53996 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
CnbpP53996 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
CnbpP53996 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
CnbpP53996 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
CnbpP53996 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
CnbpP53996 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
CnbpP53996 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
CnbpP53996 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
CnbpP53996 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
CnbpP53996 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
CnbpP53996 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
CnbpP53996 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
CnbpP53996 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
CnbpP53996 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
CnbpP53996 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
CnbpP53996 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
CnbpP53996 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
CnbpP53996 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
CnbpP53996 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
CnbpP53996 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
CnbpP53996 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
CnbpP53996 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
CnbpP53996 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
CnbpP53996 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
CnbpP53996 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
CnbpP53996 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
CnbpP53996 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
CnbpP53996 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
CnbpP53996 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
CnbpP53996 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
CnbpP53996 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
CnbpP53996 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
CnbpP53996 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
CnbpP53996 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
CnbpP53996 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
CnbpP53996 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
CnbpP53996 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
CnbpP53996 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
CnbpP53996 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
CnbpP53996 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
CnbpP53996 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
CnbpP53996 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
CnbpP53996 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
CnbpP53996 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
CnbpP53996 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
CnbpP53996 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
CnbpP53996 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
CnbpP53996 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
CnbpP53996 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
CnbpP53996 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
CnbpP53996 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
CnbpP53996 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
CnbpP53996 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
CnbpP53996 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
CnbpP53996 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
CnbpP53996 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
CnbpP53996 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
CnbpP53996 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
CnbpP53996 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
CnbpP53996 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
CnbpP53996 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
CnbpP53996 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
CnbpP53996 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
CnbpP53996 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
CnbpP53996 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
CnbpP53996 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
CnbpP53996 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
CnbpP53996 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
CnbpP53996 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
CnbpP53996 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
CnbpP53996 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
CnbpP53996 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
CnbpP53996 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
CnbpP53996 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
CnbpP53996 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
CnbpP53996 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
CnbpP53996 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
CnbpP53996 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
CnbpP53996 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
CnbpP53996 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
CnbpP53996 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
CnbpP53996 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
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