Protein–RNA interactions for Protein: P53798

Fdft1, Squalene synthase, mousemouse

Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fdft1P53798 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fdft1P53798 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Fdft1P53798 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fdft1P53798 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fdft1P53798 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fdft1P53798 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fdft1P53798 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fdft1P53798 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fdft1P53798 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fdft1P53798 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fdft1P53798 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fdft1P53798 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fdft1P53798 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fdft1P53798 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fdft1P53798 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fdft1P53798 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fdft1P53798 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Fdft1P53798 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fdft1P53798 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fdft1P53798 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fdft1P53798 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fdft1P53798 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fdft1P53798 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fdft1P53798 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fdft1P53798 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fdft1P53798 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fdft1P53798 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fdft1P53798 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fdft1P53798 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fdft1P53798 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fdft1P53798 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fdft1P53798 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fdft1P53798 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fdft1P53798 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fdft1P53798 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fdft1P53798 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fdft1P53798 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fdft1P53798 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fdft1P53798 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fdft1P53798 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fdft1P53798 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fdft1P53798 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fdft1P53798 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fdft1P53798 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fdft1P53798 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Fdft1P53798 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fdft1P53798 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Fdft1P53798 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Fdft1P53798 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Fdft1P53798 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Fdft1P53798 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Fdft1P53798 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Fdft1P53798 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fdft1P53798 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fdft1P53798 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fdft1P53798 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fdft1P53798 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fdft1P53798 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fdft1P53798 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fdft1P53798 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fdft1P53798 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fdft1P53798 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fdft1P53798 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fdft1P53798 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fdft1P53798 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fdft1P53798 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fdft1P53798 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fdft1P53798 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fdft1P53798 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fdft1P53798 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fdft1P53798 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fdft1P53798 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fdft1P53798 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fdft1P53798 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fdft1P53798 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fdft1P53798 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fdft1P53798 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fdft1P53798 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fdft1P53798 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fdft1P53798 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fdft1P53798 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fdft1P53798 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fdft1P53798 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fdft1P53798 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fdft1P53798 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fdft1P53798 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fdft1P53798 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fdft1P53798 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fdft1P53798 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fdft1P53798 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fdft1P53798 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fdft1P53798 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fdft1P53798 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fdft1P53798 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fdft1P53798 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fdft1P53798 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fdft1P53798 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fdft1P53798 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fdft1P53798 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Fdft1P53798 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms