Protein–RNA interactions for Protein: P53612

Rabggtb, Geranylgeranyl transferase type-2 subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RabggtbP53612 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RabggtbP53612 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
RabggtbP53612 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RabggtbP53612 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RabggtbP53612 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RabggtbP53612 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RabggtbP53612 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RabggtbP53612 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
RabggtbP53612 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
RabggtbP53612 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RabggtbP53612 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RabggtbP53612 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RabggtbP53612 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RabggtbP53612 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RabggtbP53612 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RabggtbP53612 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
RabggtbP53612 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RabggtbP53612 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
RabggtbP53612 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RabggtbP53612 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RabggtbP53612 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RabggtbP53612 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RabggtbP53612 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RabggtbP53612 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RabggtbP53612 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RabggtbP53612 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
RabggtbP53612 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RabggtbP53612 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RabggtbP53612 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RabggtbP53612 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
RabggtbP53612 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RabggtbP53612 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RabggtbP53612 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RabggtbP53612 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
RabggtbP53612 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RabggtbP53612 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RabggtbP53612 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
RabggtbP53612 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
RabggtbP53612 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RabggtbP53612 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
RabggtbP53612 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RabggtbP53612 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RabggtbP53612 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RabggtbP53612 Mir6420-201ENSMUST00000185032 102 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
RabggtbP53612 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
RabggtbP53612 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RabggtbP53612 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RabggtbP53612 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RabggtbP53612 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RabggtbP53612 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RabggtbP53612 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RabggtbP53612 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RabggtbP53612 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RabggtbP53612 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RabggtbP53612 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RabggtbP53612 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RabggtbP53612 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RabggtbP53612 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RabggtbP53612 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RabggtbP53612 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RabggtbP53612 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RabggtbP53612 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RabggtbP53612 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RabggtbP53612 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
RabggtbP53612 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RabggtbP53612 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RabggtbP53612 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RabggtbP53612 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RabggtbP53612 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RabggtbP53612 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RabggtbP53612 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RabggtbP53612 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
RabggtbP53612 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
RabggtbP53612 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RabggtbP53612 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RabggtbP53612 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
RabggtbP53612 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RabggtbP53612 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RabggtbP53612 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RabggtbP53612 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RabggtbP53612 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RabggtbP53612 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RabggtbP53612 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RabggtbP53612 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RabggtbP53612 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RabggtbP53612 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RabggtbP53612 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RabggtbP53612 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RabggtbP53612 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RabggtbP53612 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RabggtbP53612 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RabggtbP53612 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RabggtbP53612 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RabggtbP53612 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RabggtbP53612 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RabggtbP53612 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RabggtbP53612 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RabggtbP53612 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RabggtbP53612 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RabggtbP53612 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms