Protein–RNA interactions for Protein: P52483

Ube2e3, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 E3, mousemouse

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Length 207 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2e3P52483 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ube2e3P52483 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ube2e3P52483 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ube2e3P52483 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ube2e3P52483 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ube2e3P52483 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ube2e3P52483 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ube2e3P52483 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ube2e3P52483 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ube2e3P52483 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ube2e3P52483 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ube2e3P52483 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ube2e3P52483 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ube2e3P52483 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Ube2e3P52483 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ube2e3P52483 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ube2e3P52483 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ube2e3P52483 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ube2e3P52483 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ube2e3P52483 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ube2e3P52483 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ube2e3P52483 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ube2e3P52483 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ube2e3P52483 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ube2e3P52483 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ube2e3P52483 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ube2e3P52483 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ube2e3P52483 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Ube2e3P52483 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Ube2e3P52483 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Ube2e3P52483 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Ube2e3P52483 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ube2e3P52483 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ube2e3P52483 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ube2e3P52483 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ube2e3P52483 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ube2e3P52483 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ube2e3P52483 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ube2e3P52483 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ube2e3P52483 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ube2e3P52483 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ube2e3P52483 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ube2e3P52483 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ube2e3P52483 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ube2e3P52483 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ube2e3P52483 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ube2e3P52483 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ube2e3P52483 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ube2e3P52483 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ube2e3P52483 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ube2e3P52483 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ube2e3P52483 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ube2e3P52483 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ube2e3P52483 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ube2e3P52483 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ube2e3P52483 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ube2e3P52483 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ube2e3P52483 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Ube2e3P52483 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Ube2e3P52483 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ube2e3P52483 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ube2e3P52483 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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Ube2e3P52483 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ube2e3P52483 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ube2e3P52483 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ube2e3P52483 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ube2e3P52483 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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Ube2e3P52483 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ube2e3P52483 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ube2e3P52483 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ube2e3P52483 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ube2e3P52483 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ube2e3P52483 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ube2e3P52483 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ube2e3P52483 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ube2e3P52483 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ube2e3P52483 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ube2e3P52483 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ube2e3P52483 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ube2e3P52483 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ube2e3P52483 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ube2e3P52483 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ube2e3P52483 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ube2e3P52483 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ube2e3P52483 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ube2e3P52483 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Ube2e3P52483 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ube2e3P52483 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ube2e3P52483 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ube2e3P52483 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Ube2e3P52483 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ube2e3P52483 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ube2e3P52483 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ube2e3P52483 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Ube2e3P52483 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ube2e3P52483 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ube2e3P52483 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ube2e3P52483 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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