Protein–RNA interactions for Protein: P51944

Ccnf, Cyclin-F, mousemouse

Predictions only

Length 777 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CcnfP51944 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CcnfP51944 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CcnfP51944 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CcnfP51944 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CcnfP51944 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CcnfP51944 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
CcnfP51944 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CcnfP51944 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CcnfP51944 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CcnfP51944 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CcnfP51944 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CcnfP51944 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CcnfP51944 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CcnfP51944 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CcnfP51944 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CcnfP51944 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CcnfP51944 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CcnfP51944 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CcnfP51944 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CcnfP51944 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CcnfP51944 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CcnfP51944 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CcnfP51944 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CcnfP51944 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CcnfP51944 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
CcnfP51944 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CcnfP51944 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CcnfP51944 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CcnfP51944 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CcnfP51944 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CcnfP51944 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CcnfP51944 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CcnfP51944 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CcnfP51944 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CcnfP51944 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CcnfP51944 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CcnfP51944 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CcnfP51944 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CcnfP51944 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CcnfP51944 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CcnfP51944 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CcnfP51944 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CcnfP51944 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CcnfP51944 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CcnfP51944 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CcnfP51944 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CcnfP51944 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
CcnfP51944 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
CcnfP51944 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
CcnfP51944 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
CcnfP51944 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
CcnfP51944 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
CcnfP51944 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
CcnfP51944 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
CcnfP51944 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
CcnfP51944 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
CcnfP51944 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
CcnfP51944 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
CcnfP51944 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
CcnfP51944 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
CcnfP51944 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
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CcnfP51944 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
CcnfP51944 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
CcnfP51944 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
CcnfP51944 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
CcnfP51944 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
CcnfP51944 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
CcnfP51944 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
CcnfP51944 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
CcnfP51944 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
CcnfP51944 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
CcnfP51944 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
CcnfP51944 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC14.45□□□□□ -0.1
CcnfP51944 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
CcnfP51944 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
CcnfP51944 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
CcnfP51944 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC14.45□□□□□ -0.1
CcnfP51944 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
CcnfP51944 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
CcnfP51944 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
CcnfP51944 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
CcnfP51944 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
CcnfP51944 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
CcnfP51944 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
CcnfP51944 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
CcnfP51944 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
CcnfP51944 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
CcnfP51944 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
CcnfP51944 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
CcnfP51944 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
CcnfP51944 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
CcnfP51944 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
CcnfP51944 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
CcnfP51944 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC14.45□□□□□ -0.1
CcnfP51944 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
CcnfP51944 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
CcnfP51944 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC14.45□□□□□ -0.1
CcnfP51944 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
CcnfP51944 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
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