Protein–RNA interactions for Protein: P51827

Aff3, AF4/FMR2 family member 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,254 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aff3P51827 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Aff3P51827 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Aff3P51827 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Aff3P51827 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Aff3P51827 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Aff3P51827 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Aff3P51827 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Aff3P51827 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Aff3P51827 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Aff3P51827 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Aff3P51827 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Aff3P51827 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Aff3P51827 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Aff3P51827 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Aff3P51827 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Aff3P51827 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Aff3P51827 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Aff3P51827 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Aff3P51827 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Aff3P51827 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Aff3P51827 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Aff3P51827 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Aff3P51827 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Aff3P51827 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Aff3P51827 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Aff3P51827 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Aff3P51827 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Aff3P51827 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Aff3P51827 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Aff3P51827 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Aff3P51827 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Aff3P51827 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Aff3P51827 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Aff3P51827 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Aff3P51827 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Aff3P51827 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Aff3P51827 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Aff3P51827 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Aff3P51827 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Aff3P51827 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Aff3P51827 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Aff3P51827 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Aff3P51827 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Aff3P51827 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Aff3P51827 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Aff3P51827 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Aff3P51827 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Aff3P51827 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Aff3P51827 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Aff3P51827 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Aff3P51827 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Aff3P51827 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Aff3P51827 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Aff3P51827 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Aff3P51827 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Aff3P51827 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Aff3P51827 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Aff3P51827 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Aff3P51827 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Aff3P51827 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Aff3P51827 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Aff3P51827 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Aff3P51827 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Aff3P51827 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Aff3P51827 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Aff3P51827 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Aff3P51827 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Aff3P51827 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Aff3P51827 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Aff3P51827 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Aff3P51827 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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