Protein–RNA interactions for Protein: P50704

Defa6, Alpha-defensin 6/12, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa6P50704 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Defa6P50704 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Defa6P50704 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Defa6P50704 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Defa6P50704 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Defa6P50704 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Defa6P50704 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Defa6P50704 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Defa6P50704 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Defa6P50704 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Defa6P50704 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Defa6P50704 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Defa6P50704 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Defa6P50704 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Defa6P50704 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Defa6P50704 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Defa6P50704 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Defa6P50704 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Defa6P50704 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Defa6P50704 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Defa6P50704 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Defa6P50704 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Defa6P50704 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Defa6P50704 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Defa6P50704 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Defa6P50704 Nwd2-201ENSMUST00000159584 8534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Defa6P50704 Pappa-201ENSMUST00000084501 11027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Defa6P50704 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Defa6P50704 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Defa6P50704 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Defa6P50704 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Defa6P50704 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Defa6P50704 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Defa6P50704 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Defa6P50704 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Defa6P50704 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Defa6P50704 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Defa6P50704 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Defa6P50704 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Defa6P50704 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Defa6P50704 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Defa6P50704 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Defa6P50704 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Defa6P50704 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Defa6P50704 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Defa6P50704 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Defa6P50704 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Defa6P50704 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Defa6P50704 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Defa6P50704 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Defa6P50704 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Defa6P50704 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Defa6P50704 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Defa6P50704 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Defa6P50704 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Defa6P50704 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Defa6P50704 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Defa6P50704 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Defa6P50704 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Defa6P50704 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Defa6P50704 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Defa6P50704 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Defa6P50704 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Defa6P50704 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Defa6P50704 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Defa6P50704 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Defa6P50704 Zc3h4-202ENSMUST00000209289 5853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Defa6P50704 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Defa6P50704 Spag9-202ENSMUST00000041956 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Defa6P50704 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Defa6P50704 Bach2-202ENSMUST00000108180 8882 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Defa6P50704 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Defa6P50704 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Defa6P50704 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Defa6P50704 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Defa6P50704 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Defa6P50704 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Defa6P50704 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Defa6P50704 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Defa6P50704 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Defa6P50704 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Defa6P50704 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Defa6P50704 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Defa6P50704 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Defa6P50704 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Defa6P50704 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Defa6P50704 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Defa6P50704 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Defa6P50704 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Defa6P50704 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Defa6P50704 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Defa6P50704 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Defa6P50704 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Defa6P50704 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Defa6P50704 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Defa6P50704 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Defa6P50704 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Defa6P50704 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Defa6P50704 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Defa6P50704 Col14a1-203ENSMUST00000110221 5679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.8 ms