Protein–RNA interactions for Protein: P50637

Tspo, Translocator protein, mousemouse

Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TspoP50637 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
TspoP50637 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
TspoP50637 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
TspoP50637 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
TspoP50637 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.82□□□□□ -0.36
TspoP50637 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC12.82□□□□□ -0.36
TspoP50637 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
TspoP50637 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
TspoP50637 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
TspoP50637 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
TspoP50637 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
TspoP50637 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
TspoP50637 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC12.82□□□□□ -0.36
TspoP50637 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
TspoP50637 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
TspoP50637 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
TspoP50637 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
TspoP50637 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
TspoP50637 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
TspoP50637 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
TspoP50637 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
TspoP50637 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
TspoP50637 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
TspoP50637 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
TspoP50637 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
TspoP50637 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
TspoP50637 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
TspoP50637 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
TspoP50637 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
TspoP50637 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
TspoP50637 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
TspoP50637 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC12.81□□□□□ -0.36
TspoP50637 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
TspoP50637 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
TspoP50637 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC12.81□□□□□ -0.36
TspoP50637 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
TspoP50637 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
TspoP50637 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
TspoP50637 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC12.81□□□□□ -0.36
TspoP50637 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
TspoP50637 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
TspoP50637 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
TspoP50637 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
TspoP50637 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
TspoP50637 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
TspoP50637 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
TspoP50637 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
TspoP50637 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
TspoP50637 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
TspoP50637 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
TspoP50637 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
TspoP50637 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
TspoP50637 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
TspoP50637 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
TspoP50637 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
TspoP50637 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
TspoP50637 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
TspoP50637 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
TspoP50637 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
TspoP50637 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC12.8□□□□□ -0.36
TspoP50637 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
TspoP50637 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
TspoP50637 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
TspoP50637 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
TspoP50637 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
TspoP50637 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
TspoP50637 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC12.8□□□□□ -0.36
TspoP50637 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
TspoP50637 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.8□□□□□ -0.36
TspoP50637 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
TspoP50637 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
TspoP50637 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
TspoP50637 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
TspoP50637 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
TspoP50637 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
TspoP50637 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
TspoP50637 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
TspoP50637 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
TspoP50637 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
TspoP50637 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
TspoP50637 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
TspoP50637 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
TspoP50637 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
TspoP50637 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
TspoP50637 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
TspoP50637 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
TspoP50637 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
TspoP50637 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
TspoP50637 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
TspoP50637 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
TspoP50637 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
TspoP50637 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
TspoP50637 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
TspoP50637 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
TspoP50637 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
TspoP50637 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
TspoP50637 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
TspoP50637 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
TspoP50637 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
TspoP50637 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms