Protein–RNA interactions for Protein: P49817

Cav1, Caveolin-1, mousemouse

Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cav1P49817 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cav1P49817 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cav1P49817 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Cav1P49817 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cav1P49817 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cav1P49817 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cav1P49817 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cav1P49817 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cav1P49817 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cav1P49817 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cav1P49817 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cav1P49817 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cav1P49817 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cav1P49817 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cav1P49817 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cav1P49817 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cav1P49817 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cav1P49817 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cav1P49817 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cav1P49817 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cav1P49817 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cav1P49817 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Cav1P49817 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cav1P49817 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cav1P49817 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cav1P49817 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cav1P49817 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cav1P49817 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cav1P49817 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cav1P49817 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cav1P49817 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Cav1P49817 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cav1P49817 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cav1P49817 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cav1P49817 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cav1P49817 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cav1P49817 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cav1P49817 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Cav1P49817 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cav1P49817 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cav1P49817 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cav1P49817 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cav1P49817 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cav1P49817 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cav1P49817 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cav1P49817 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cav1P49817 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cav1P49817 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cav1P49817 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cav1P49817 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cav1P49817 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cav1P49817 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cav1P49817 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cav1P49817 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cav1P49817 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cav1P49817 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cav1P49817 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cav1P49817 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cav1P49817 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cav1P49817 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cav1P49817 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cav1P49817 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cav1P49817 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cav1P49817 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cav1P49817 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cav1P49817 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cav1P49817 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cav1P49817 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cav1P49817 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cav1P49817 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cav1P49817 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cav1P49817 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cav1P49817 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cav1P49817 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cav1P49817 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cav1P49817 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cav1P49817 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Cav1P49817 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cav1P49817 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Cav1P49817 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Cav1P49817 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cav1P49817 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Cav1P49817 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cav1P49817 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cav1P49817 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cav1P49817 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cav1P49817 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cav1P49817 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cav1P49817 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cav1P49817 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cav1P49817 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cav1P49817 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cav1P49817 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cav1P49817 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cav1P49817 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cav1P49817 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cav1P49817 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Cav1P49817 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cav1P49817 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cav1P49817 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms