Protein–RNA interactions for Protein: P49813

Tmod1, Tropomodulin-1, mousemouse

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Length 359 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmod1P49813 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
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Tmod1P49813 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Tmod1P49813 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
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Tmod1P49813 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Tmod1P49813 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
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Tmod1P49813 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tmod1P49813 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tmod1P49813 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tmod1P49813 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tmod1P49813 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tmod1P49813 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tmod1P49813 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tmod1P49813 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
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Tmod1P49813 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tmod1P49813 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tmod1P49813 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Tmod1P49813 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tmod1P49813 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tmod1P49813 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tmod1P49813 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
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Tmod1P49813 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
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Tmod1P49813 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tmod1P49813 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
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Tmod1P49813 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tmod1P49813 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tmod1P49813 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tmod1P49813 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tmod1P49813 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tmod1P49813 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tmod1P49813 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tmod1P49813 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tmod1P49813 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tmod1P49813 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tmod1P49813 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tmod1P49813 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tmod1P49813 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
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Tmod1P49813 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tmod1P49813 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
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Tmod1P49813 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
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Tmod1P49813 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
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Tmod1P49813 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tmod1P49813 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tmod1P49813 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
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Tmod1P49813 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
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Tmod1P49813 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tmod1P49813 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tmod1P49813 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tmod1P49813 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tmod1P49813 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tmod1P49813 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tmod1P49813 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tmod1P49813 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tmod1P49813 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tmod1P49813 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tmod1P49813 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tmod1P49813 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tmod1P49813 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tmod1P49813 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tmod1P49813 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tmod1P49813 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tmod1P49813 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tmod1P49813 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tmod1P49813 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tmod1P49813 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tmod1P49813 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tmod1P49813 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tmod1P49813 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tmod1P49813 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tmod1P49813 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tmod1P49813 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tmod1P49813 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Tmod1P49813 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tmod1P49813 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
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