Protein–RNA interactions for Protein: P49769

Psen1, Presenilin-1, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psen1P49769 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Psen1P49769 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Psen1P49769 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Psen1P49769 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Psen1P49769 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Psen1P49769 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Psen1P49769 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Psen1P49769 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Psen1P49769 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Psen1P49769 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Psen1P49769 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Psen1P49769 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Psen1P49769 2010310C07Rik-202ENSMUST00000190889 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Psen1P49769 Gm42726-201ENSMUST00000202274 1286 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Psen1P49769 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Psen1P49769 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Psen1P49769 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Psen1P49769 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Psen1P49769 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Psen1P49769 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Psen1P49769 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Psen1P49769 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Psen1P49769 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Psen1P49769 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Psen1P49769 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Psen1P49769 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Psen1P49769 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Psen1P49769 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Psen1P49769 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Psen1P49769 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Psen1P49769 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Psen1P49769 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Psen1P49769 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Psen1P49769 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Psen1P49769 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Psen1P49769 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Psen1P49769 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Psen1P49769 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Psen1P49769 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Psen1P49769 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Psen1P49769 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Psen1P49769 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Psen1P49769 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Psen1P49769 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Psen1P49769 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Psen1P49769 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Psen1P49769 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Psen1P49769 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Psen1P49769 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Psen1P49769 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Psen1P49769 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Psen1P49769 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Psen1P49769 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Psen1P49769 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Psen1P49769 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Psen1P49769 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Psen1P49769 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Psen1P49769 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Psen1P49769 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Psen1P49769 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Psen1P49769 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Psen1P49769 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Psen1P49769 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Psen1P49769 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Psen1P49769 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Psen1P49769 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Psen1P49769 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Psen1P49769 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Psen1P49769 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Psen1P49769 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Psen1P49769 Tmem30c-202ENSMUST00000119407 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Psen1P49769 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Psen1P49769 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Psen1P49769 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Psen1P49769 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Psen1P49769 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Psen1P49769 Gm14913-201ENSMUST00000120011 1093 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Psen1P49769 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Psen1P49769 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Psen1P49769 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Psen1P49769 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Psen1P49769 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Psen1P49769 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Psen1P49769 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Psen1P49769 Cd59a-201ENSMUST00000040423 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Psen1P49769 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Psen1P49769 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Psen1P49769 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Psen1P49769 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Psen1P49769 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Psen1P49769 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Psen1P49769 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Psen1P49769 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Psen1P49769 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Psen1P49769 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Psen1P49769 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Psen1P49769 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Psen1P49769 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Psen1P49769 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Psen1P49769 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms