Protein–RNA interactions for Protein: P49025

Cit, Citron Rho-interacting kinase, mousemouse

Predictions only

Length 2,055 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CitP49025 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CitP49025 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CitP49025 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CitP49025 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CitP49025 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CitP49025 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CitP49025 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CitP49025 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CitP49025 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CitP49025 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CitP49025 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CitP49025 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CitP49025 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CitP49025 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CitP49025 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CitP49025 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CitP49025 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CitP49025 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CitP49025 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CitP49025 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CitP49025 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CitP49025 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CitP49025 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CitP49025 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CitP49025 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CitP49025 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CitP49025 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CitP49025 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CitP49025 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CitP49025 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CitP49025 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CitP49025 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CitP49025 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CitP49025 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CitP49025 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CitP49025 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CitP49025 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CitP49025 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CitP49025 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CitP49025 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CitP49025 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CitP49025 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CitP49025 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CitP49025 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CitP49025 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CitP49025 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CitP49025 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CitP49025 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CitP49025 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CitP49025 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CitP49025 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CitP49025 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CitP49025 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CitP49025 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CitP49025 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CitP49025 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CitP49025 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CitP49025 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CitP49025 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CitP49025 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CitP49025 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CitP49025 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CitP49025 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CitP49025 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CitP49025 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CitP49025 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CitP49025 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CitP49025 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CitP49025 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CitP49025 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CitP49025 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CitP49025 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CitP49025 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CitP49025 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CitP49025 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CitP49025 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CitP49025 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CitP49025 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CitP49025 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CitP49025 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CitP49025 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CitP49025 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CitP49025 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CitP49025 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CitP49025 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CitP49025 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CitP49025 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CitP49025 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CitP49025 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CitP49025 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CitP49025 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CitP49025 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CitP49025 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CitP49025 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CitP49025 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CitP49025 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CitP49025 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CitP49025 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CitP49025 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CitP49025 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms