Protein–RNA interactions for Protein: P48787

Tnni3, Troponin I, cardiac muscle, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnni3P48787 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tnni3P48787 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tnni3P48787 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tnni3P48787 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tnni3P48787 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tnni3P48787 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Tnni3P48787 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tnni3P48787 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tnni3P48787 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tnni3P48787 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tnni3P48787 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tnni3P48787 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tnni3P48787 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Tnni3P48787 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tnni3P48787 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tnni3P48787 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Tnni3P48787 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.26
Tnni3P48787 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Tnni3P48787 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tnni3P48787 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tnni3P48787 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tnni3P48787 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tnni3P48787 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tnni3P48787 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tnni3P48787 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tnni3P48787 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tnni3P48787 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tnni3P48787 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tnni3P48787 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tnni3P48787 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Tnni3P48787 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Tnni3P48787 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tnni3P48787 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tnni3P48787 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tnni3P48787 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tnni3P48787 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tnni3P48787 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tnni3P48787 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tnni3P48787 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tnni3P48787 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tnni3P48787 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tnni3P48787 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tnni3P48787 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tnni3P48787 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tnni3P48787 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tnni3P48787 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tnni3P48787 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tnni3P48787 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tnni3P48787 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tnni3P48787 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tnni3P48787 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tnni3P48787 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tnni3P48787 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tnni3P48787 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tnni3P48787 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tnni3P48787 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tnni3P48787 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tnni3P48787 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tnni3P48787 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tnni3P48787 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tnni3P48787 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tnni3P48787 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tnni3P48787 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Tnni3P48787 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tnni3P48787 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tnni3P48787 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Tnni3P48787 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tnni3P48787 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tnni3P48787 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tnni3P48787 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tnni3P48787 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tnni3P48787 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tnni3P48787 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tnni3P48787 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tnni3P48787 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tnni3P48787 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tnni3P48787 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tnni3P48787 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tnni3P48787 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tnni3P48787 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tnni3P48787 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tnni3P48787 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tnni3P48787 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tnni3P48787 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tnni3P48787 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tnni3P48787 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tnni3P48787 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tnni3P48787 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tnni3P48787 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tnni3P48787 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tnni3P48787 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tnni3P48787 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tnni3P48787 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tnni3P48787 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tnni3P48787 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tnni3P48787 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tnni3P48787 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tnni3P48787 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tnni3P48787 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tnni3P48787 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.1 ms