Protein–RNA interactions for Protein: P48281

Vdr, Vitamin D3 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VdrP48281 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VdrP48281 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VdrP48281 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VdrP48281 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VdrP48281 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VdrP48281 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
VdrP48281 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
VdrP48281 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VdrP48281 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
VdrP48281 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VdrP48281 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VdrP48281 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VdrP48281 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VdrP48281 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VdrP48281 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VdrP48281 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VdrP48281 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VdrP48281 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VdrP48281 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VdrP48281 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VdrP48281 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
VdrP48281 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VdrP48281 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VdrP48281 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VdrP48281 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
VdrP48281 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VdrP48281 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VdrP48281 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
VdrP48281 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
VdrP48281 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VdrP48281 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VdrP48281 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VdrP48281 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
VdrP48281 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
VdrP48281 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VdrP48281 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VdrP48281 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VdrP48281 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VdrP48281 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
VdrP48281 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VdrP48281 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
VdrP48281 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VdrP48281 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
VdrP48281 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VdrP48281 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VdrP48281 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VdrP48281 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
VdrP48281 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VdrP48281 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VdrP48281 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VdrP48281 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VdrP48281 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VdrP48281 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VdrP48281 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
VdrP48281 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VdrP48281 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VdrP48281 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
VdrP48281 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VdrP48281 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VdrP48281 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VdrP48281 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
VdrP48281 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VdrP48281 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VdrP48281 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VdrP48281 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VdrP48281 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
VdrP48281 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VdrP48281 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
VdrP48281 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VdrP48281 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VdrP48281 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VdrP48281 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
VdrP48281 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VdrP48281 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VdrP48281 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VdrP48281 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VdrP48281 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
VdrP48281 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VdrP48281 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
VdrP48281 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VdrP48281 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
VdrP48281 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VdrP48281 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VdrP48281 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
VdrP48281 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
VdrP48281 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
VdrP48281 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
VdrP48281 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
VdrP48281 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
VdrP48281 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
VdrP48281 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
VdrP48281 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
VdrP48281 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
VdrP48281 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
VdrP48281 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
VdrP48281 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
VdrP48281 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
VdrP48281 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
VdrP48281 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
VdrP48281 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms