Protein–RNA interactions for Protein: P47867

Scg3, Secretogranin-3, mousemouse

Predictions only

Length 471 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scg3P47867 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Scg3P47867 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Scg3P47867 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Scg3P47867 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Scg3P47867 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Scg3P47867 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Scg3P47867 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Scg3P47867 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Scg3P47867 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Scg3P47867 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Scg3P47867 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Scg3P47867 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Scg3P47867 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Scg3P47867 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Scg3P47867 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Scg3P47867 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Scg3P47867 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Scg3P47867 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Scg3P47867 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Scg3P47867 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Scg3P47867 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Scg3P47867 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Scg3P47867 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Scg3P47867 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Scg3P47867 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Scg3P47867 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Scg3P47867 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Scg3P47867 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Scg3P47867 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Scg3P47867 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Scg3P47867 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Scg3P47867 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Scg3P47867 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Scg3P47867 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Scg3P47867 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Scg3P47867 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Scg3P47867 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Scg3P47867 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Scg3P47867 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Scg3P47867 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Scg3P47867 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Scg3P47867 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Scg3P47867 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Scg3P47867 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Scg3P47867 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Scg3P47867 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Scg3P47867 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Scg3P47867 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Scg3P47867 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Scg3P47867 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Scg3P47867 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Scg3P47867 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Scg3P47867 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Scg3P47867 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Scg3P47867 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Scg3P47867 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Scg3P47867 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Scg3P47867 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Scg3P47867 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Scg3P47867 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Scg3P47867 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Scg3P47867 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Scg3P47867 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Scg3P47867 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Scg3P47867 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Scg3P47867 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Scg3P47867 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Scg3P47867 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Scg3P47867 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Scg3P47867 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Scg3P47867 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Scg3P47867 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Scg3P47867 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Scg3P47867 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Scg3P47867 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Scg3P47867 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Scg3P47867 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Scg3P47867 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Scg3P47867 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Scg3P47867 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Scg3P47867 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Scg3P47867 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Scg3P47867 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Scg3P47867 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Scg3P47867 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Scg3P47867 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Scg3P47867 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Scg3P47867 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Scg3P47867 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Scg3P47867 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Scg3P47867 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Scg3P47867 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Scg3P47867 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Scg3P47867 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Scg3P47867 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Scg3P47867 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Scg3P47867 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Scg3P47867 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Scg3P47867 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Scg3P47867 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 111.9 ms