Protein–RNA interactions for Protein: P40201

Chd1, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,711 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chd1P40201 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Chd1P40201 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Chd1P40201 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Chd1P40201 Olfr1209-201ENSMUST00000099809 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Chd1P40201 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Chd1P40201 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Chd1P40201 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Chd1P40201 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Chd1P40201 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Chd1P40201 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Chd1P40201 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Chd1P40201 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Chd1P40201 Gm15869-201ENSMUST00000126427 734 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Chd1P40201 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Chd1P40201 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Chd1P40201 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Chd1P40201 Gm27572-201ENSMUST00000183702 255 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Chd1P40201 Mir8109-201ENSMUST00000184375 117 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Chd1P40201 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Chd1P40201 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Chd1P40201 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Chd1P40201 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Chd1P40201 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Chd1P40201 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Chd1P40201 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Chd1P40201 Gm18222-201ENSMUST00000202416 1387 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Chd1P40201 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Chd1P40201 Rhox2g-201ENSMUST00000115169 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Chd1P40201 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Chd1P40201 Gm15351-201ENSMUST00000123920 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Chd1P40201 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Chd1P40201 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Chd1P40201 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Chd1P40201 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Chd1P40201 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Chd1P40201 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Chd1P40201 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Chd1P40201 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Chd1P40201 Nudt17-202ENSMUST00000171249 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Chd1P40201 Gm38241-201ENSMUST00000192641 898 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Chd1P40201 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Chd1P40201 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Chd1P40201 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Chd1P40201 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Chd1P40201 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Chd1P40201 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Chd1P40201 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Chd1P40201 Gm27514-201ENSMUST00000183692 110 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Chd1P40201 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Chd1P40201 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Chd1P40201 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Chd1P40201 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Chd1P40201 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Chd1P40201 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Chd1P40201 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Chd1P40201 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Chd1P40201 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Chd1P40201 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Chd1P40201 Rpl10-201ENSMUST00000008826 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Chd1P40201 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Chd1P40201 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Chd1P40201 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Chd1P40201 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Chd1P40201 Rps2-ps9-201ENSMUST00000121414 817 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Chd1P40201 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Chd1P40201 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Chd1P40201 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Chd1P40201 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Chd1P40201 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Chd1P40201 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Chd1P40201 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Chd1P40201 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Chd1P40201 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Chd1P40201 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Chd1P40201 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Chd1P40201 Gm34084-201ENSMUST00000222236 1298 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Chd1P40201 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Chd1P40201 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Chd1P40201 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Chd1P40201 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Chd1P40201 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Chd1P40201 Gm26542-201ENSMUST00000180443 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Chd1P40201 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Chd1P40201 Gm33474-201ENSMUST00000199486 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Chd1P40201 Svip-203ENSMUST00000209193 487 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Chd1P40201 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Chd1P40201 Olfr707-201ENSMUST00000088687 924 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Chd1P40201 Olfr1532-ps1-201ENSMUST00000098140 924 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Chd1P40201 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Chd1P40201 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Chd1P40201 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Chd1P40201 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Chd1P40201 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Chd1P40201 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Chd1P40201 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Chd1P40201 Gm20646-201ENSMUST00000176807 1316 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Chd1P40201 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Chd1P40201 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Chd1P40201 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Chd1P40201 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.8 ms