Protein–RNA interactions for Protein: P37913

Lig1, DNA ligase 1, mousemouse

Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lig1P37913 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Lig1P37913 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Lig1P37913 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Lig1P37913 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Lig1P37913 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Lig1P37913 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Lig1P37913 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Lig1P37913 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Lig1P37913 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Lig1P37913 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Lig1P37913 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Lig1P37913 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Lig1P37913 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Lig1P37913 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Lig1P37913 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Lig1P37913 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Lig1P37913 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Lig1P37913 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Lig1P37913 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Lig1P37913 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Lig1P37913 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Lig1P37913 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Lig1P37913 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Lig1P37913 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Lig1P37913 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Lig1P37913 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Lig1P37913 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Lig1P37913 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Lig1P37913 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Lig1P37913 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Lig1P37913 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Lig1P37913 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Lig1P37913 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Lig1P37913 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Lig1P37913 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Lig1P37913 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Lig1P37913 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Lig1P37913 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Lig1P37913 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Lig1P37913 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Lig1P37913 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Lig1P37913 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Lig1P37913 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Lig1P37913 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Lig1P37913 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Lig1P37913 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Lig1P37913 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Lig1P37913 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Lig1P37913 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Lig1P37913 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Lig1P37913 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Lig1P37913 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Lig1P37913 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Lig1P37913 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Lig1P37913 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Lig1P37913 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Lig1P37913 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Lig1P37913 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Lig1P37913 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Lig1P37913 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Lig1P37913 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Lig1P37913 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Lig1P37913 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Lig1P37913 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Lig1P37913 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Lig1P37913 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Lig1P37913 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Lig1P37913 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Lig1P37913 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Lig1P37913 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Lig1P37913 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Lig1P37913 Gm22065-201ENSMUST00000103753 110 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Lig1P37913 Gm22066-201ENSMUST00000103761 110 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Lig1P37913 Gm24932-201ENSMUST00000103763 110 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Lig1P37913 Gm24115-201ENSMUST00000103799 110 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Lig1P37913 Gm22190-201ENSMUST00000103827 110 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Lig1P37913 Gm22191-201ENSMUST00000103831 110 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Lig1P37913 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Lig1P37913 Gm24721-201ENSMUST00000103849 110 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Lig1P37913 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Lig1P37913 Gm28018-201ENSMUST00000103869 110 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Lig1P37913 Gm26399-201ENSMUST00000103937 110 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Lig1P37913 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Lig1P37913 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Lig1P37913 Gm25349-201ENSMUST00000177728 110 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Lig1P37913 Gm23616-201ENSMUST00000177797 110 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Lig1P37913 Gm25871-201ENSMUST00000177816 110 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Lig1P37913 Gm24752-201ENSMUST00000178240 110 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Lig1P37913 Gm24496-201ENSMUST00000178287 110 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Lig1P37913 Gm25649-201ENSMUST00000178476 110 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Lig1P37913 Gm25548-201ENSMUST00000178681 110 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Lig1P37913 Gm23147-201ENSMUST00000178841 110 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Lig1P37913 Gm26095-201ENSMUST00000179270 110 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Lig1P37913 Gm22171-201ENSMUST00000179283 110 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Lig1P37913 Gm23936-201ENSMUST00000179354 110 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Lig1P37913 Gm22619-201ENSMUST00000179516 110 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Lig1P37913 Gm25255-201ENSMUST00000179579 110 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Lig1P37913 Gm24755-201ENSMUST00000179691 110 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Lig1P37913 Gm26506-201ENSMUST00000179692 110 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Lig1P37913 Gm25086-201ENSMUST00000179931 110 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms