Protein–RNA interactions for Protein: P37238

Pparg, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma, mousemouse

Predictions only

Length 505 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PpargP37238 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PpargP37238 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PpargP37238 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PpargP37238 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
PpargP37238 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PpargP37238 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PpargP37238 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PpargP37238 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PpargP37238 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PpargP37238 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PpargP37238 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PpargP37238 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PpargP37238 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PpargP37238 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PpargP37238 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
PpargP37238 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
PpargP37238 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PpargP37238 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PpargP37238 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PpargP37238 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PpargP37238 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PpargP37238 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PpargP37238 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PpargP37238 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PpargP37238 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
PpargP37238 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PpargP37238 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PpargP37238 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PpargP37238 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PpargP37238 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PpargP37238 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PpargP37238 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PpargP37238 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PpargP37238 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PpargP37238 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PpargP37238 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PpargP37238 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PpargP37238 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PpargP37238 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PpargP37238 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PpargP37238 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
PpargP37238 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PpargP37238 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
PpargP37238 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
PpargP37238 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PpargP37238 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PpargP37238 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PpargP37238 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PpargP37238 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PpargP37238 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PpargP37238 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PpargP37238 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC15.39■□□□□ 0.06
PpargP37238 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PpargP37238 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PpargP37238 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PpargP37238 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PpargP37238 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PpargP37238 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PpargP37238 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PpargP37238 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PpargP37238 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
PpargP37238 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PpargP37238 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PpargP37238 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PpargP37238 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
PpargP37238 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PpargP37238 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PpargP37238 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PpargP37238 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PpargP37238 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PpargP37238 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PpargP37238 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PpargP37238 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PpargP37238 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PpargP37238 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PpargP37238 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PpargP37238 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PpargP37238 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PpargP37238 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PpargP37238 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PpargP37238 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PpargP37238 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PpargP37238 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PpargP37238 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PpargP37238 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PpargP37238 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PpargP37238 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PpargP37238 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PpargP37238 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PpargP37238 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PpargP37238 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PpargP37238 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PpargP37238 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PpargP37238 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PpargP37238 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PpargP37238 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PpargP37238 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PpargP37238 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PpargP37238 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PpargP37238 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms