Protein–RNA interactions for Protein: P36536

Sar1a, GTP-binding protein SAR1a, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sar1aP36536 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sar1aP36536 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sar1aP36536 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sar1aP36536 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sar1aP36536 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sar1aP36536 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sar1aP36536 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sar1aP36536 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sar1aP36536 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sar1aP36536 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sar1aP36536 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sar1aP36536 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Sar1aP36536 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Sar1aP36536 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sar1aP36536 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sar1aP36536 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sar1aP36536 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sar1aP36536 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sar1aP36536 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sar1aP36536 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sar1aP36536 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sar1aP36536 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sar1aP36536 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sar1aP36536 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sar1aP36536 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sar1aP36536 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sar1aP36536 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sar1aP36536 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sar1aP36536 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sar1aP36536 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sar1aP36536 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sar1aP36536 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sar1aP36536 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sar1aP36536 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sar1aP36536 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sar1aP36536 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sar1aP36536 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sar1aP36536 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sar1aP36536 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Sar1aP36536 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Sar1aP36536 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Sar1aP36536 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sar1aP36536 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sar1aP36536 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Sar1aP36536 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sar1aP36536 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Sar1aP36536 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sar1aP36536 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sar1aP36536 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sar1aP36536 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sar1aP36536 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sar1aP36536 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sar1aP36536 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sar1aP36536 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sar1aP36536 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sar1aP36536 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sar1aP36536 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sar1aP36536 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sar1aP36536 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sar1aP36536 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sar1aP36536 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sar1aP36536 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sar1aP36536 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sar1aP36536 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sar1aP36536 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sar1aP36536 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sar1aP36536 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sar1aP36536 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sar1aP36536 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sar1aP36536 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sar1aP36536 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sar1aP36536 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sar1aP36536 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sar1aP36536 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sar1aP36536 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sar1aP36536 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sar1aP36536 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sar1aP36536 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sar1aP36536 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sar1aP36536 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sar1aP36536 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sar1aP36536 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sar1aP36536 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sar1aP36536 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sar1aP36536 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sar1aP36536 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sar1aP36536 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sar1aP36536 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sar1aP36536 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sar1aP36536 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sar1aP36536 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sar1aP36536 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sar1aP36536 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sar1aP36536 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sar1aP36536 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sar1aP36536 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sar1aP36536 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sar1aP36536 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sar1aP36536 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sar1aP36536 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms