Protein–RNA interactions for Protein: P35639

Ddit3, DNA damage-inducible transcript 3 protein, mousemouse

Predictions only

Length 168 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddit3P35639 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Ddit3P35639 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Ddit3P35639 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Ddit3P35639 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Ddit3P35639 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ddit3P35639 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ddit3P35639 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ddit3P35639 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ddit3P35639 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ddit3P35639 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Ddit3P35639 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ddit3P35639 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ddit3P35639 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ddit3P35639 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ddit3P35639 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ddit3P35639 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ddit3P35639 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ddit3P35639 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Ddit3P35639 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ddit3P35639 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ddit3P35639 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ddit3P35639 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ddit3P35639 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ddit3P35639 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Ddit3P35639 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Ddit3P35639 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ddit3P35639 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Ddit3P35639 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ddit3P35639 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ddit3P35639 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ddit3P35639 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ddit3P35639 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ddit3P35639 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ddit3P35639 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ddit3P35639 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ddit3P35639 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ddit3P35639 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ddit3P35639 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ddit3P35639 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ddit3P35639 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ddit3P35639 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ddit3P35639 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ddit3P35639 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ddit3P35639 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ddit3P35639 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ddit3P35639 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ddit3P35639 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ddit3P35639 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Ddit3P35639 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Ddit3P35639 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ddit3P35639 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ddit3P35639 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Ddit3P35639 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ddit3P35639 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ddit3P35639 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ddit3P35639 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ddit3P35639 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ddit3P35639 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ddit3P35639 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ddit3P35639 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ddit3P35639 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ddit3P35639 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ddit3P35639 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ddit3P35639 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ddit3P35639 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ddit3P35639 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ddit3P35639 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ddit3P35639 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Ddit3P35639 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Ddit3P35639 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ddit3P35639 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ddit3P35639 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ddit3P35639 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ddit3P35639 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ddit3P35639 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ddit3P35639 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Ddit3P35639 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ddit3P35639 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Ddit3P35639 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ddit3P35639 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ddit3P35639 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ddit3P35639 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ddit3P35639 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ddit3P35639 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ddit3P35639 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ddit3P35639 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ddit3P35639 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ddit3P35639 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ddit3P35639 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ddit3P35639 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ddit3P35639 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ddit3P35639 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ddit3P35639 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ddit3P35639 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ddit3P35639 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ddit3P35639 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ddit3P35639 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ddit3P35639 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ddit3P35639 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ddit3P35639 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.7 ms