Protein–RNA interactions for Protein: P34152

Ptk2, Focal adhesion kinase 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,090 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptk2P34152 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Ptk2P34152 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Ptk2P34152 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Ptk2P34152 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Ptk2P34152 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Ptk2P34152 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Ptk2P34152 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Ptk2P34152 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Ptk2P34152 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ptk2P34152 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ptk2P34152 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ptk2P34152 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ptk2P34152 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ptk2P34152 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ptk2P34152 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ptk2P34152 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ptk2P34152 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ptk2P34152 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ptk2P34152 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ptk2P34152 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ptk2P34152 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ptk2P34152 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ptk2P34152 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ptk2P34152 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Ptk2P34152 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ptk2P34152 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ptk2P34152 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ptk2P34152 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ptk2P34152 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ptk2P34152 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ptk2P34152 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ptk2P34152 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Ptk2P34152 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ptk2P34152 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Ptk2P34152 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Ptk2P34152 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ptk2P34152 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ptk2P34152 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ptk2P34152 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ptk2P34152 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ptk2P34152 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ptk2P34152 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ptk2P34152 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ptk2P34152 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ptk2P34152 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ptk2P34152 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ptk2P34152 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ptk2P34152 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ptk2P34152 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ptk2P34152 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ptk2P34152 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ptk2P34152 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ptk2P34152 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ptk2P34152 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ptk2P34152 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ptk2P34152 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ptk2P34152 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ptk2P34152 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ptk2P34152 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ptk2P34152 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ptk2P34152 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Ptk2P34152 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ptk2P34152 Hmgb1-202ENSMUST00000093196 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ptk2P34152 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ptk2P34152 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ptk2P34152 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ptk2P34152 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ptk2P34152 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ptk2P34152 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ptk2P34152 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ptk2P34152 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ptk2P34152 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ptk2P34152 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ptk2P34152 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ptk2P34152 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ptk2P34152 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ptk2P34152 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ptk2P34152 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ptk2P34152 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ptk2P34152 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ptk2P34152 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ptk2P34152 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ptk2P34152 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ptk2P34152 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ptk2P34152 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ptk2P34152 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ptk2P34152 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ptk2P34152 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ptk2P34152 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ptk2P34152 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ptk2P34152 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ptk2P34152 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ptk2P34152 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ptk2P34152 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ptk2P34152 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ptk2P34152 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ptk2P34152 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ptk2P34152 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ptk2P34152 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Ptk2P34152 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms