Protein–RNA interactions for Protein: P30873

Sstr1, Somatostatin receptor type 1, mousemouse

Predictions only

Length 391 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sstr1P30873 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sstr1P30873 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sstr1P30873 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sstr1P30873 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sstr1P30873 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sstr1P30873 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sstr1P30873 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sstr1P30873 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sstr1P30873 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Sstr1P30873 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sstr1P30873 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sstr1P30873 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sstr1P30873 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sstr1P30873 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sstr1P30873 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sstr1P30873 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sstr1P30873 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sstr1P30873 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sstr1P30873 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sstr1P30873 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sstr1P30873 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sstr1P30873 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sstr1P30873 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sstr1P30873 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sstr1P30873 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sstr1P30873 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sstr1P30873 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sstr1P30873 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sstr1P30873 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sstr1P30873 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sstr1P30873 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sstr1P30873 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Sstr1P30873 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sstr1P30873 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sstr1P30873 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sstr1P30873 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sstr1P30873 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sstr1P30873 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sstr1P30873 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sstr1P30873 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sstr1P30873 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sstr1P30873 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sstr1P30873 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sstr1P30873 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sstr1P30873 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sstr1P30873 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sstr1P30873 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Sstr1P30873 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Sstr1P30873 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sstr1P30873 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sstr1P30873 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sstr1P30873 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sstr1P30873 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sstr1P30873 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sstr1P30873 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sstr1P30873 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sstr1P30873 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sstr1P30873 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sstr1P30873 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sstr1P30873 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sstr1P30873 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sstr1P30873 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sstr1P30873 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sstr1P30873 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sstr1P30873 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sstr1P30873 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sstr1P30873 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sstr1P30873 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sstr1P30873 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sstr1P30873 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sstr1P30873 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sstr1P30873 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sstr1P30873 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sstr1P30873 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sstr1P30873 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sstr1P30873 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sstr1P30873 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Sstr1P30873 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sstr1P30873 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sstr1P30873 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sstr1P30873 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sstr1P30873 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sstr1P30873 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sstr1P30873 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sstr1P30873 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sstr1P30873 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sstr1P30873 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sstr1P30873 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sstr1P30873 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sstr1P30873 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sstr1P30873 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sstr1P30873 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sstr1P30873 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sstr1P30873 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sstr1P30873 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sstr1P30873 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sstr1P30873 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Sstr1P30873 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sstr1P30873 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sstr1P30873 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms