Protein–RNA interactions for Protein: P29352

Ptpn22, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 22, mousemouse

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Length 802 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn22P29352 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ptpn22P29352 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ptpn22P29352 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ptpn22P29352 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ptpn22P29352 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ptpn22P29352 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Ptpn22P29352 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ptpn22P29352 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Ptpn22P29352 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ptpn22P29352 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ptpn22P29352 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Ptpn22P29352 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Ptpn22P29352 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ptpn22P29352 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Ptpn22P29352 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ptpn22P29352 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Ptpn22P29352 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Ptpn22P29352 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ptpn22P29352 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Ptpn22P29352 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ptpn22P29352 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ptpn22P29352 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ptpn22P29352 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ptpn22P29352 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ptpn22P29352 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ptpn22P29352 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ptpn22P29352 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ptpn22P29352 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ptpn22P29352 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ptpn22P29352 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ptpn22P29352 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ptpn22P29352 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ptpn22P29352 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ptpn22P29352 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ptpn22P29352 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ptpn22P29352 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ptpn22P29352 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ptpn22P29352 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ptpn22P29352 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ptpn22P29352 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ptpn22P29352 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ptpn22P29352 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ptpn22P29352 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Ptpn22P29352 Gm45331-201ENSMUST00000209868 554 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Ptpn22P29352 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Ptpn22P29352 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Ptpn22P29352 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ptpn22P29352 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ptpn22P29352 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Ptpn22P29352 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ptpn22P29352 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ptpn22P29352 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ptpn22P29352 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Ptpn22P29352 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ptpn22P29352 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Ptpn22P29352 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Ptpn22P29352 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ptpn22P29352 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ptpn22P29352 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ptpn22P29352 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ptpn22P29352 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ptpn22P29352 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Ptpn22P29352 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Ptpn22P29352 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Ptpn22P29352 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ptpn22P29352 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ptpn22P29352 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ptpn22P29352 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ptpn22P29352 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ptpn22P29352 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ptpn22P29352 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ptpn22P29352 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ptpn22P29352 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ptpn22P29352 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ptpn22P29352 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ptpn22P29352 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ptpn22P29352 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ptpn22P29352 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Ptpn22P29352 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ptpn22P29352 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ptpn22P29352 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ptpn22P29352 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ptpn22P29352 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ptpn22P29352 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ptpn22P29352 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.2 ms