Protein–RNA interactions for Protein: P28867

Prkcd, Protein kinase C delta type, mousemouse

Predictions only

Length 674 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcdP28867 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PrkcdP28867 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PrkcdP28867 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PrkcdP28867 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PrkcdP28867 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PrkcdP28867 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PrkcdP28867 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PrkcdP28867 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PrkcdP28867 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PrkcdP28867 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PrkcdP28867 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PrkcdP28867 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PrkcdP28867 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
PrkcdP28867 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PrkcdP28867 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PrkcdP28867 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PrkcdP28867 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PrkcdP28867 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PrkcdP28867 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PrkcdP28867 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PrkcdP28867 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PrkcdP28867 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
PrkcdP28867 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PrkcdP28867 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PrkcdP28867 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
PrkcdP28867 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PrkcdP28867 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PrkcdP28867 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PrkcdP28867 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PrkcdP28867 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PrkcdP28867 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PrkcdP28867 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PrkcdP28867 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PrkcdP28867 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PrkcdP28867 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PrkcdP28867 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PrkcdP28867 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PrkcdP28867 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PrkcdP28867 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PrkcdP28867 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PrkcdP28867 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PrkcdP28867 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PrkcdP28867 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PrkcdP28867 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PrkcdP28867 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
PrkcdP28867 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PrkcdP28867 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PrkcdP28867 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PrkcdP28867 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PrkcdP28867 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PrkcdP28867 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PrkcdP28867 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PrkcdP28867 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PrkcdP28867 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PrkcdP28867 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PrkcdP28867 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PrkcdP28867 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PrkcdP28867 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PrkcdP28867 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PrkcdP28867 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PrkcdP28867 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PrkcdP28867 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
PrkcdP28867 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
PrkcdP28867 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PrkcdP28867 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PrkcdP28867 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PrkcdP28867 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PrkcdP28867 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
PrkcdP28867 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PrkcdP28867 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PrkcdP28867 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
PrkcdP28867 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PrkcdP28867 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PrkcdP28867 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PrkcdP28867 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
PrkcdP28867 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PrkcdP28867 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC15.08■□□□□ 0
PrkcdP28867 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PrkcdP28867 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PrkcdP28867 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PrkcdP28867 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PrkcdP28867 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PrkcdP28867 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PrkcdP28867 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PrkcdP28867 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PrkcdP28867 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PrkcdP28867 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PrkcdP28867 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PrkcdP28867 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PrkcdP28867 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PrkcdP28867 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PrkcdP28867 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC15.08■□□□□ 0
PrkcdP28867 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PrkcdP28867 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PrkcdP28867 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PrkcdP28867 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PrkcdP28867 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PrkcdP28867 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PrkcdP28867 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PrkcdP28867 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms