Protein–RNA interactions for Protein: P28738

Kif5c, Kinesin heavy chain isoform 5C, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 956 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kif5cP28738 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Kif5cP28738 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Kif5cP28738 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Kif5cP28738 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Kif5cP28738 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Kif5cP28738 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Kif5cP28738 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Kif5cP28738 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Kif5cP28738 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Kif5cP28738 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Kif5cP28738 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Kif5cP28738 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Kif5cP28738 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Kif5cP28738 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Kif5cP28738 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Kif5cP28738 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Kif5cP28738 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Kif5cP28738 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Kif5cP28738 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Kif5cP28738 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Kif5cP28738 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Kif5cP28738 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Kif5cP28738 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Kif5cP28738 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Kif5cP28738 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Kif5cP28738 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Kif5cP28738 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Kif5cP28738 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Kif5cP28738 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Kif5cP28738 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Kif5cP28738 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Kif5cP28738 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Kif5cP28738 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Kif5cP28738 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Kif5cP28738 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Kif5cP28738 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Kif5cP28738 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Kif5cP28738 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Kif5cP28738 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Kif5cP28738 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Kif5cP28738 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Kif5cP28738 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Kif5cP28738 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Kif5cP28738 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Kif5cP28738 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Kif5cP28738 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Kif5cP28738 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Kif5cP28738 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Kif5cP28738 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Kif5cP28738 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Kif5cP28738 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Kif5cP28738 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Kif5cP28738 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Kif5cP28738 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Kif5cP28738 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Kif5cP28738 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Kif5cP28738 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Kif5cP28738 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Kif5cP28738 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Kif5cP28738 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Kif5cP28738 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Kif5cP28738 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Kif5cP28738 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Kif5cP28738 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Kif5cP28738 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Kif5cP28738 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
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Kif5cP28738 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Kif5cP28738 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Kif5cP28738 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Kif5cP28738 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Kif5cP28738 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Kif5cP28738 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Kif5cP28738 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Kif5cP28738 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Kif5cP28738 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Kif5cP28738 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Kif5cP28738 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Kif5cP28738 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Kif5cP28738 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Kif5cP28738 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Kif5cP28738 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Kif5cP28738 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Kif5cP28738 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Kif5cP28738 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Kif5cP28738 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Kif5cP28738 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Kif5cP28738 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Kif5cP28738 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Kif5cP28738 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Kif5cP28738 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Kif5cP28738 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Kif5cP28738 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Kif5cP28738 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Kif5cP28738 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Kif5cP28738 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Kif5cP28738 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Kif5cP28738 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Kif5cP28738 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms