Protein–RNA interactions for Protein: P28700

Rxra, Retinoic acid receptor RXR-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxraP28700 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
RxraP28700 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RxraP28700 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RxraP28700 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RxraP28700 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RxraP28700 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
RxraP28700 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RxraP28700 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RxraP28700 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RxraP28700 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
RxraP28700 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RxraP28700 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RxraP28700 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RxraP28700 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RxraP28700 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RxraP28700 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RxraP28700 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
RxraP28700 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RxraP28700 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RxraP28700 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
RxraP28700 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RxraP28700 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RxraP28700 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RxraP28700 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RxraP28700 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RxraP28700 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RxraP28700 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RxraP28700 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RxraP28700 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RxraP28700 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RxraP28700 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RxraP28700 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RxraP28700 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RxraP28700 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RxraP28700 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
RxraP28700 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RxraP28700 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RxraP28700 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
RxraP28700 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RxraP28700 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RxraP28700 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RxraP28700 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RxraP28700 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RxraP28700 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RxraP28700 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RxraP28700 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RxraP28700 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RxraP28700 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RxraP28700 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RxraP28700 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RxraP28700 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RxraP28700 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RxraP28700 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RxraP28700 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RxraP28700 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RxraP28700 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RxraP28700 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RxraP28700 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RxraP28700 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RxraP28700 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RxraP28700 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RxraP28700 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RxraP28700 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
RxraP28700 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RxraP28700 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RxraP28700 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RxraP28700 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RxraP28700 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RxraP28700 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RxraP28700 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RxraP28700 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RxraP28700 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RxraP28700 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RxraP28700 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RxraP28700 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RxraP28700 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
RxraP28700 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RxraP28700 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RxraP28700 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RxraP28700 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RxraP28700 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RxraP28700 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RxraP28700 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RxraP28700 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RxraP28700 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RxraP28700 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RxraP28700 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RxraP28700 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RxraP28700 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RxraP28700 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
RxraP28700 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RxraP28700 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RxraP28700 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RxraP28700 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RxraP28700 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RxraP28700 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RxraP28700 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RxraP28700 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
RxraP28700 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
RxraP28700 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms