Protein–RNA interactions for Protein: P28481

Col2a1, Collagen alpha-1(II) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,487 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col2a1P28481 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Col2a1P28481 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Col2a1P28481 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Col2a1P28481 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Col2a1P28481 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Col2a1P28481 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Col2a1P28481 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Col2a1P28481 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Col2a1P28481 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Col2a1P28481 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Col2a1P28481 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Col2a1P28481 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Col2a1P28481 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Col2a1P28481 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Col2a1P28481 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Col2a1P28481 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Col2a1P28481 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Col2a1P28481 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Col2a1P28481 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Col2a1P28481 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Col2a1P28481 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Col2a1P28481 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Col2a1P28481 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Col2a1P28481 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Col2a1P28481 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Col2a1P28481 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Col2a1P28481 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Col2a1P28481 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Col2a1P28481 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Col2a1P28481 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Col2a1P28481 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Col2a1P28481 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Col2a1P28481 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Col2a1P28481 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Col2a1P28481 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Col2a1P28481 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Col2a1P28481 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Col2a1P28481 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Col2a1P28481 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Col2a1P28481 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Col2a1P28481 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Col2a1P28481 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Col2a1P28481 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Col2a1P28481 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Col2a1P28481 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Col2a1P28481 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Col2a1P28481 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Col2a1P28481 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Col2a1P28481 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Col2a1P28481 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Col2a1P28481 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Col2a1P28481 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Col2a1P28481 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Col2a1P28481 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Col2a1P28481 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Col2a1P28481 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Col2a1P28481 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Col2a1P28481 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Col2a1P28481 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Col2a1P28481 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Col2a1P28481 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Col2a1P28481 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Col2a1P28481 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Col2a1P28481 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Col2a1P28481 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Col2a1P28481 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Col2a1P28481 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Col2a1P28481 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Col2a1P28481 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Col2a1P28481 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Col2a1P28481 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Col2a1P28481 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Col2a1P28481 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Col2a1P28481 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Col2a1P28481 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Col2a1P28481 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Col2a1P28481 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Col2a1P28481 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Col2a1P28481 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Col2a1P28481 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Col2a1P28481 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Col2a1P28481 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Col2a1P28481 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Col2a1P28481 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Col2a1P28481 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Col2a1P28481 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Col2a1P28481 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Col2a1P28481 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Col2a1P28481 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Col2a1P28481 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Col2a1P28481 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Col2a1P28481 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Col2a1P28481 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Col2a1P28481 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Col2a1P28481 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Col2a1P28481 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Col2a1P28481 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Col2a1P28481 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Col2a1P28481 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Col2a1P28481 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms