Protein–RNA interactions for Protein: P28231

Gjb3, Gap junction beta-3 protein, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb3P28231 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gjb3P28231 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gjb3P28231 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gjb3P28231 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gjb3P28231 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gjb3P28231 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gjb3P28231 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gjb3P28231 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Gjb3P28231 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gjb3P28231 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gjb3P28231 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gjb3P28231 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gjb3P28231 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gjb3P28231 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gjb3P28231 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gjb3P28231 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gjb3P28231 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gjb3P28231 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gjb3P28231 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gjb3P28231 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gjb3P28231 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gjb3P28231 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gjb3P28231 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gjb3P28231 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Gjb3P28231 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Gjb3P28231 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gjb3P28231 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gjb3P28231 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gjb3P28231 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gjb3P28231 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gjb3P28231 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Gjb3P28231 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gjb3P28231 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Gjb3P28231 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Gjb3P28231 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gjb3P28231 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gjb3P28231 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gjb3P28231 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gjb3P28231 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gjb3P28231 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gjb3P28231 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gjb3P28231 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gjb3P28231 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gjb3P28231 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gjb3P28231 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gjb3P28231 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gjb3P28231 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gjb3P28231 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gjb3P28231 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gjb3P28231 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Gjb3P28231 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gjb3P28231 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gjb3P28231 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gjb3P28231 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gjb3P28231 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gjb3P28231 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gjb3P28231 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gjb3P28231 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gjb3P28231 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Gjb3P28231 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gjb3P28231 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gjb3P28231 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Gjb3P28231 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Gjb3P28231 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Gjb3P28231 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gjb3P28231 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gjb3P28231 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gjb3P28231 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gjb3P28231 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gjb3P28231 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gjb3P28231 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gjb3P28231 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gjb3P28231 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gjb3P28231 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gjb3P28231 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gjb3P28231 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gjb3P28231 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gjb3P28231 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gjb3P28231 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gjb3P28231 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gjb3P28231 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gjb3P28231 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gjb3P28231 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gjb3P28231 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gjb3P28231 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gjb3P28231 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gjb3P28231 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gjb3P28231 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gjb3P28231 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gjb3P28231 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gjb3P28231 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gjb3P28231 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gjb3P28231 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gjb3P28231 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gjb3P28231 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Gjb3P28231 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gjb3P28231 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gjb3P28231 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gjb3P28231 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gjb3P28231 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.4 ms