Protein–RNA interactions for Protein: P28229

Gjc1, Gap junction gamma-1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjc1P28229 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gjc1P28229 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gjc1P28229 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gjc1P28229 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gjc1P28229 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gjc1P28229 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Gjc1P28229 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gjc1P28229 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gjc1P28229 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Gjc1P28229 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Gjc1P28229 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gjc1P28229 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gjc1P28229 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gjc1P28229 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gjc1P28229 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gjc1P28229 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gjc1P28229 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gjc1P28229 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gjc1P28229 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gjc1P28229 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gjc1P28229 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gjc1P28229 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gjc1P28229 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gjc1P28229 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gjc1P28229 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gjc1P28229 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gjc1P28229 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gjc1P28229 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gjc1P28229 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gjc1P28229 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gjc1P28229 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Gjc1P28229 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gjc1P28229 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gjc1P28229 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gjc1P28229 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gjc1P28229 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gjc1P28229 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gjc1P28229 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Gjc1P28229 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gjc1P28229 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gjc1P28229 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gjc1P28229 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gjc1P28229 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gjc1P28229 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gjc1P28229 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gjc1P28229 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gjc1P28229 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gjc1P28229 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gjc1P28229 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gjc1P28229 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gjc1P28229 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gjc1P28229 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Gjc1P28229 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gjc1P28229 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gjc1P28229 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Gjc1P28229 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Gjc1P28229 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gjc1P28229 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gjc1P28229 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gjc1P28229 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gjc1P28229 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gjc1P28229 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gjc1P28229 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gjc1P28229 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gjc1P28229 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gjc1P28229 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gjc1P28229 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gjc1P28229 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gjc1P28229 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gjc1P28229 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gjc1P28229 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gjc1P28229 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gjc1P28229 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gjc1P28229 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Gjc1P28229 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gjc1P28229 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gjc1P28229 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gjc1P28229 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gjc1P28229 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gjc1P28229 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gjc1P28229 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gjc1P28229 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gjc1P28229 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gjc1P28229 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gjc1P28229 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gjc1P28229 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gjc1P28229 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gjc1P28229 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Gjc1P28229 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gjc1P28229 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gjc1P28229 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gjc1P28229 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gjc1P28229 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gjc1P28229 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gjc1P28229 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gjc1P28229 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gjc1P28229 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gjc1P28229 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gjc1P28229 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gjc1P28229 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms