Protein–RNA interactions for Protein: P27641

Xrcc5, X-ray repair cross-complementing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 732 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xrcc5P27641 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Xrcc5P27641 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Xrcc5P27641 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Xrcc5P27641 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Xrcc5P27641 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Xrcc5P27641 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Xrcc5P27641 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Xrcc5P27641 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Xrcc5P27641 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Xrcc5P27641 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Xrcc5P27641 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Xrcc5P27641 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Xrcc5P27641 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Xrcc5P27641 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Xrcc5P27641 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Xrcc5P27641 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Xrcc5P27641 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Xrcc5P27641 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Xrcc5P27641 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Xrcc5P27641 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Xrcc5P27641 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Xrcc5P27641 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Xrcc5P27641 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Xrcc5P27641 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Xrcc5P27641 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Xrcc5P27641 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Xrcc5P27641 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Xrcc5P27641 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Xrcc5P27641 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Xrcc5P27641 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Xrcc5P27641 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Xrcc5P27641 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Xrcc5P27641 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Xrcc5P27641 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Xrcc5P27641 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Xrcc5P27641 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Xrcc5P27641 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Xrcc5P27641 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Xrcc5P27641 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Xrcc5P27641 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Xrcc5P27641 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Xrcc5P27641 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Xrcc5P27641 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Xrcc5P27641 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Xrcc5P27641 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Xrcc5P27641 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Xrcc5P27641 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Xrcc5P27641 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Xrcc5P27641 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Xrcc5P27641 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Xrcc5P27641 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Xrcc5P27641 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Xrcc5P27641 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Xrcc5P27641 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Xrcc5P27641 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Xrcc5P27641 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Xrcc5P27641 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Xrcc5P27641 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Xrcc5P27641 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Xrcc5P27641 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Xrcc5P27641 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Xrcc5P27641 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Xrcc5P27641 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Xrcc5P27641 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Xrcc5P27641 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Xrcc5P27641 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Xrcc5P27641 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Xrcc5P27641 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Xrcc5P27641 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Xrcc5P27641 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Xrcc5P27641 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Xrcc5P27641 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Xrcc5P27641 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Xrcc5P27641 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Xrcc5P27641 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Xrcc5P27641 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Xrcc5P27641 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Xrcc5P27641 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Xrcc5P27641 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Xrcc5P27641 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Xrcc5P27641 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Xrcc5P27641 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Xrcc5P27641 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Xrcc5P27641 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Xrcc5P27641 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Xrcc5P27641 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Xrcc5P27641 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Xrcc5P27641 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Xrcc5P27641 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Xrcc5P27641 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Xrcc5P27641 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Xrcc5P27641 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Xrcc5P27641 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Xrcc5P27641 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Xrcc5P27641 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Xrcc5P27641 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Xrcc5P27641 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Xrcc5P27641 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Xrcc5P27641 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Xrcc5P27641 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms