Protein–RNA interactions for Protein: P24788

Cdk11b, Cyclin-dependent kinase 11B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 784 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk11bP24788 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Cdk11bP24788 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Cdk11bP24788 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cdk11bP24788 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cdk11bP24788 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cdk11bP24788 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cdk11bP24788 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cdk11bP24788 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cdk11bP24788 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cdk11bP24788 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cdk11bP24788 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cdk11bP24788 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cdk11bP24788 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cdk11bP24788 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cdk11bP24788 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cdk11bP24788 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cdk11bP24788 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Cdk11bP24788 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cdk11bP24788 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cdk11bP24788 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cdk11bP24788 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cdk11bP24788 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cdk11bP24788 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cdk11bP24788 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cdk11bP24788 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cdk11bP24788 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Cdk11bP24788 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cdk11bP24788 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Cdk11bP24788 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cdk11bP24788 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cdk11bP24788 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cdk11bP24788 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cdk11bP24788 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cdk11bP24788 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cdk11bP24788 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cdk11bP24788 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Cdk11bP24788 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Cdk11bP24788 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Cdk11bP24788 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Cdk11bP24788 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Cdk11bP24788 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Cdk11bP24788 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Cdk11bP24788 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cdk11bP24788 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cdk11bP24788 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cdk11bP24788 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cdk11bP24788 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cdk11bP24788 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cdk11bP24788 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cdk11bP24788 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cdk11bP24788 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cdk11bP24788 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Cdk11bP24788 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cdk11bP24788 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cdk11bP24788 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cdk11bP24788 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cdk11bP24788 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cdk11bP24788 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cdk11bP24788 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cdk11bP24788 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cdk11bP24788 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cdk11bP24788 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cdk11bP24788 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cdk11bP24788 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cdk11bP24788 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cdk11bP24788 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cdk11bP24788 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cdk11bP24788 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cdk11bP24788 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Cdk11bP24788 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cdk11bP24788 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cdk11bP24788 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cdk11bP24788 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cdk11bP24788 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cdk11bP24788 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cdk11bP24788 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cdk11bP24788 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Cdk11bP24788 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cdk11bP24788 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cdk11bP24788 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cdk11bP24788 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cdk11bP24788 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cdk11bP24788 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cdk11bP24788 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cdk11bP24788 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cdk11bP24788 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cdk11bP24788 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cdk11bP24788 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cdk11bP24788 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cdk11bP24788 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Cdk11bP24788 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cdk11bP24788 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cdk11bP24788 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cdk11bP24788 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cdk11bP24788 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cdk11bP24788 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cdk11bP24788 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cdk11bP24788 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cdk11bP24788 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cdk11bP24788 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms