Protein–RNA interactions for Protein: P24161

Cd247, T-cell surface glycoprotein CD3 zeta chain, mousemouse

Predictions only

Length 164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd247P24161 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cd247P24161 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cd247P24161 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cd247P24161 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cd247P24161 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Cd247P24161 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Cd247P24161 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Cd247P24161 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cd247P24161 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Cd247P24161 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Cd247P24161 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cd247P24161 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cd247P24161 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cd247P24161 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cd247P24161 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Cd247P24161 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Cd247P24161 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cd247P24161 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cd247P24161 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cd247P24161 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cd247P24161 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cd247P24161 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cd247P24161 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cd247P24161 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cd247P24161 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cd247P24161 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cd247P24161 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cd247P24161 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cd247P24161 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cd247P24161 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cd247P24161 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cd247P24161 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cd247P24161 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cd247P24161 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cd247P24161 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cd247P24161 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cd247P24161 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Cd247P24161 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cd247P24161 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Cd247P24161 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Cd247P24161 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cd247P24161 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cd247P24161 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cd247P24161 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cd247P24161 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cd247P24161 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cd247P24161 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cd247P24161 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cd247P24161 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cd247P24161 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cd247P24161 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Cd247P24161 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cd247P24161 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cd247P24161 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cd247P24161 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cd247P24161 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cd247P24161 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cd247P24161 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cd247P24161 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cd247P24161 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cd247P24161 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cd247P24161 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cd247P24161 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cd247P24161 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cd247P24161 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cd247P24161 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cd247P24161 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cd247P24161 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cd247P24161 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Cd247P24161 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cd247P24161 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cd247P24161 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cd247P24161 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cd247P24161 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cd247P24161 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cd247P24161 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cd247P24161 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cd247P24161 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cd247P24161 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cd247P24161 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cd247P24161 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cd247P24161 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cd247P24161 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cd247P24161 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cd247P24161 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cd247P24161 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cd247P24161 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cd247P24161 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cd247P24161 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Cd247P24161 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cd247P24161 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Cd247P24161 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cd247P24161 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cd247P24161 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Cd247P24161 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cd247P24161 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cd247P24161 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cd247P24161 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cd247P24161 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cd247P24161 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 92.8 ms