Protein–RNA interactions for Protein: P23812

Hoxd12, Homeobox protein Hox-D12, mousemouse

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Length 268 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd12P23812 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hoxd12P23812 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hoxd12P23812 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hoxd12P23812 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hoxd12P23812 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hoxd12P23812 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hoxd12P23812 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hoxd12P23812 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hoxd12P23812 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hoxd12P23812 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hoxd12P23812 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hoxd12P23812 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hoxd12P23812 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hoxd12P23812 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hoxd12P23812 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hoxd12P23812 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hoxd12P23812 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hoxd12P23812 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hoxd12P23812 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hoxd12P23812 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hoxd12P23812 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hoxd12P23812 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hoxd12P23812 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hoxd12P23812 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hoxd12P23812 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hoxd12P23812 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hoxd12P23812 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Hoxd12P23812 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Hoxd12P23812 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hoxd12P23812 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hoxd12P23812 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hoxd12P23812 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hoxd12P23812 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hoxd12P23812 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hoxd12P23812 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hoxd12P23812 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hoxd12P23812 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hoxd12P23812 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hoxd12P23812 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hoxd12P23812 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hoxd12P23812 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hoxd12P23812 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hoxd12P23812 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hoxd12P23812 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hoxd12P23812 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hoxd12P23812 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hoxd12P23812 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hoxd12P23812 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hoxd12P23812 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hoxd12P23812 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hoxd12P23812 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hoxd12P23812 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Hoxd12P23812 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hoxd12P23812 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hoxd12P23812 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hoxd12P23812 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hoxd12P23812 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hoxd12P23812 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hoxd12P23812 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hoxd12P23812 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hoxd12P23812 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hoxd12P23812 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hoxd12P23812 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hoxd12P23812 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hoxd12P23812 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxd12P23812 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxd12P23812 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxd12P23812 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxd12P23812 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxd12P23812 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxd12P23812 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxd12P23812 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxd12P23812 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxd12P23812 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxd12P23812 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxd12P23812 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxd12P23812 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxd12P23812 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxd12P23812 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxd12P23812 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxd12P23812 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxd12P23812 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxd12P23812 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxd12P23812 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxd12P23812 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxd12P23812 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxd12P23812 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxd12P23812 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxd12P23812 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxd12P23812 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxd12P23812 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxd12P23812 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxd12P23812 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxd12P23812 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxd12P23812 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxd12P23812 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxd12P23812 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxd12P23812 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxd12P23812 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxd12P23812 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
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