Protein–RNA interactions for Protein: P23298

Prkch, Protein kinase C eta type, mousemouse

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Length 683 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkchP23298 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PrkchP23298 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PrkchP23298 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PrkchP23298 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PrkchP23298 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PrkchP23298 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PrkchP23298 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PrkchP23298 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PrkchP23298 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PrkchP23298 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PrkchP23298 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PrkchP23298 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
PrkchP23298 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PrkchP23298 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
PrkchP23298 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PrkchP23298 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
PrkchP23298 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
PrkchP23298 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
PrkchP23298 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PrkchP23298 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PrkchP23298 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PrkchP23298 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PrkchP23298 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PrkchP23298 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PrkchP23298 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PrkchP23298 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PrkchP23298 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PrkchP23298 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PrkchP23298 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PrkchP23298 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PrkchP23298 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PrkchP23298 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
PrkchP23298 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PrkchP23298 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PrkchP23298 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PrkchP23298 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PrkchP23298 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PrkchP23298 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PrkchP23298 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PrkchP23298 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PrkchP23298 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PrkchP23298 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PrkchP23298 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PrkchP23298 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PrkchP23298 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PrkchP23298 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
PrkchP23298 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
PrkchP23298 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PrkchP23298 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PrkchP23298 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PrkchP23298 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PrkchP23298 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PrkchP23298 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PrkchP23298 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PrkchP23298 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PrkchP23298 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PrkchP23298 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PrkchP23298 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PrkchP23298 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PrkchP23298 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PrkchP23298 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PrkchP23298 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PrkchP23298 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PrkchP23298 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PrkchP23298 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PrkchP23298 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PrkchP23298 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PrkchP23298 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PrkchP23298 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PrkchP23298 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PrkchP23298 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PrkchP23298 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PrkchP23298 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PrkchP23298 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PrkchP23298 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PrkchP23298 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PrkchP23298 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PrkchP23298 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PrkchP23298 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PrkchP23298 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PrkchP23298 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PrkchP23298 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PrkchP23298 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PrkchP23298 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PrkchP23298 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PrkchP23298 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PrkchP23298 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PrkchP23298 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PrkchP23298 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PrkchP23298 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PrkchP23298 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PrkchP23298 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PrkchP23298 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
PrkchP23298 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PrkchP23298 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PrkchP23298 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PrkchP23298 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PrkchP23298 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PrkchP23298 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PrkchP23298 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
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