Protein–RNA interactions for Protein: P23242

Gja1, Gap junction alpha-1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gja1P23242 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gja1P23242 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gja1P23242 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gja1P23242 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gja1P23242 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gja1P23242 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gja1P23242 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gja1P23242 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Gja1P23242 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gja1P23242 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gja1P23242 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gja1P23242 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gja1P23242 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gja1P23242 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gja1P23242 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Gja1P23242 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gja1P23242 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gja1P23242 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gja1P23242 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gja1P23242 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gja1P23242 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gja1P23242 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gja1P23242 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gja1P23242 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gja1P23242 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gja1P23242 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gja1P23242 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gja1P23242 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gja1P23242 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gja1P23242 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gja1P23242 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gja1P23242 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gja1P23242 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gja1P23242 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gja1P23242 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gja1P23242 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gja1P23242 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gja1P23242 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gja1P23242 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gja1P23242 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gja1P23242 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gja1P23242 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gja1P23242 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gja1P23242 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gja1P23242 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gja1P23242 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gja1P23242 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Gja1P23242 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gja1P23242 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gja1P23242 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gja1P23242 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gja1P23242 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gja1P23242 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gja1P23242 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gja1P23242 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gja1P23242 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gja1P23242 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gja1P23242 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gja1P23242 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gja1P23242 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gja1P23242 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gja1P23242 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gja1P23242 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gja1P23242 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Gja1P23242 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gja1P23242 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gja1P23242 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gja1P23242 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gja1P23242 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gja1P23242 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gja1P23242 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gja1P23242 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gja1P23242 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gja1P23242 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gja1P23242 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gja1P23242 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gja1P23242 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Gja1P23242 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gja1P23242 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gja1P23242 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gja1P23242 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gja1P23242 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gja1P23242 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gja1P23242 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Gja1P23242 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gja1P23242 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gja1P23242 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gja1P23242 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gja1P23242 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gja1P23242 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gja1P23242 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gja1P23242 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gja1P23242 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gja1P23242 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gja1P23242 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gja1P23242 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gja1P23242 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gja1P23242 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gja1P23242 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gja1P23242 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms