Protein–RNA interactions for Protein: P21958

Tap1, Antigen peptide transporter 1, mousemouse

Predictions only

Length 724 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tap1P21958 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tap1P21958 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tap1P21958 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tap1P21958 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tap1P21958 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tap1P21958 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tap1P21958 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tap1P21958 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tap1P21958 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tap1P21958 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tap1P21958 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tap1P21958 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tap1P21958 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tap1P21958 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tap1P21958 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Tap1P21958 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tap1P21958 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tap1P21958 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tap1P21958 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tap1P21958 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tap1P21958 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tap1P21958 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tap1P21958 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tap1P21958 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tap1P21958 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tap1P21958 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tap1P21958 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tap1P21958 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tap1P21958 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Tap1P21958 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Tap1P21958 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tap1P21958 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tap1P21958 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tap1P21958 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tap1P21958 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tap1P21958 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tap1P21958 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tap1P21958 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tap1P21958 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tap1P21958 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tap1P21958 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tap1P21958 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tap1P21958 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tap1P21958 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tap1P21958 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tap1P21958 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tap1P21958 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tap1P21958 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tap1P21958 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tap1P21958 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tap1P21958 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tap1P21958 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tap1P21958 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tap1P21958 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tap1P21958 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tap1P21958 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tap1P21958 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tap1P21958 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tap1P21958 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Tap1P21958 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tap1P21958 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tap1P21958 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tap1P21958 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tap1P21958 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Tap1P21958 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tap1P21958 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tap1P21958 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tap1P21958 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tap1P21958 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tap1P21958 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tap1P21958 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tap1P21958 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tap1P21958 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tap1P21958 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tap1P21958 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tap1P21958 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tap1P21958 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tap1P21958 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tap1P21958 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tap1P21958 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tap1P21958 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tap1P21958 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tap1P21958 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tap1P21958 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tap1P21958 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tap1P21958 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tap1P21958 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tap1P21958 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tap1P21958 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tap1P21958 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tap1P21958 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tap1P21958 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tap1P21958 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tap1P21958 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tap1P21958 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tap1P21958 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Tap1P21958 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tap1P21958 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Tap1P21958 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tap1P21958 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.6 ms