Protein–RNA interactions for Protein: P19123

Tnnc1, Troponin C, slow skeletal and cardiac muscles, mousemouse

Predictions only

Length 161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnc1P19123 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tnnc1P19123 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tnnc1P19123 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tnnc1P19123 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tnnc1P19123 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tnnc1P19123 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tnnc1P19123 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tnnc1P19123 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tnnc1P19123 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tnnc1P19123 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tnnc1P19123 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tnnc1P19123 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tnnc1P19123 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tnnc1P19123 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tnnc1P19123 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tnnc1P19123 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tnnc1P19123 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Tnnc1P19123 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Tnnc1P19123 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tnnc1P19123 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tnnc1P19123 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tnnc1P19123 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tnnc1P19123 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Tnnc1P19123 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Tnnc1P19123 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Tnnc1P19123 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tnnc1P19123 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tnnc1P19123 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tnnc1P19123 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tnnc1P19123 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tnnc1P19123 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tnnc1P19123 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tnnc1P19123 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tnnc1P19123 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tnnc1P19123 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tnnc1P19123 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tnnc1P19123 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tnnc1P19123 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tnnc1P19123 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tnnc1P19123 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tnnc1P19123 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tnnc1P19123 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tnnc1P19123 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tnnc1P19123 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tnnc1P19123 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tnnc1P19123 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tnnc1P19123 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Tnnc1P19123 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tnnc1P19123 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tnnc1P19123 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tnnc1P19123 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tnnc1P19123 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tnnc1P19123 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Tnnc1P19123 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tnnc1P19123 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Tnnc1P19123 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tnnc1P19123 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tnnc1P19123 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tnnc1P19123 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tnnc1P19123 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tnnc1P19123 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tnnc1P19123 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tnnc1P19123 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tnnc1P19123 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tnnc1P19123 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tnnc1P19123 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tnnc1P19123 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tnnc1P19123 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tnnc1P19123 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tnnc1P19123 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tnnc1P19123 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tnnc1P19123 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tnnc1P19123 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tnnc1P19123 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Tnnc1P19123 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tnnc1P19123 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tnnc1P19123 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tnnc1P19123 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tnnc1P19123 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tnnc1P19123 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tnnc1P19123 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tnnc1P19123 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tnnc1P19123 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tnnc1P19123 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tnnc1P19123 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tnnc1P19123 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Tnnc1P19123 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tnnc1P19123 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tnnc1P19123 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tnnc1P19123 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tnnc1P19123 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tnnc1P19123 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tnnc1P19123 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tnnc1P19123 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tnnc1P19123 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tnnc1P19123 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Tnnc1P19123 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tnnc1P19123 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tnnc1P19123 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tnnc1P19123 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms