Protein–RNA interactions for Protein: P18911

Rarg, Retinoic acid receptor gamma, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RargP18911 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RargP18911 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RargP18911 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RargP18911 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RargP18911 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RargP18911 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
RargP18911 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RargP18911 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
RargP18911 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RargP18911 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RargP18911 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RargP18911 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
RargP18911 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RargP18911 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RargP18911 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RargP18911 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RargP18911 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RargP18911 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RargP18911 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
RargP18911 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RargP18911 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RargP18911 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RargP18911 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RargP18911 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RargP18911 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RargP18911 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RargP18911 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RargP18911 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RargP18911 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RargP18911 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RargP18911 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RargP18911 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RargP18911 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RargP18911 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RargP18911 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RargP18911 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RargP18911 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RargP18911 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RargP18911 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RargP18911 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RargP18911 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RargP18911 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RargP18911 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RargP18911 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RargP18911 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RargP18911 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
RargP18911 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
RargP18911 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
RargP18911 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
RargP18911 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.21
RargP18911 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
RargP18911 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
RargP18911 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
RargP18911 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RargP18911 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RargP18911 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RargP18911 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RargP18911 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
RargP18911 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RargP18911 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RargP18911 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RargP18911 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RargP18911 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RargP18911 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RargP18911 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RargP18911 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RargP18911 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RargP18911 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RargP18911 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RargP18911 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RargP18911 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RargP18911 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RargP18911 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
RargP18911 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RargP18911 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RargP18911 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RargP18911 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RargP18911 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RargP18911 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RargP18911 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RargP18911 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RargP18911 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RargP18911 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RargP18911 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
RargP18911 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RargP18911 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RargP18911 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RargP18911 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RargP18911 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RargP18911 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RargP18911 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RargP18911 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RargP18911 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RargP18911 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RargP18911 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RargP18911 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RargP18911 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RargP18911 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RargP18911 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RargP18911 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms