Protein–RNA interactions for Protein: P16014

Chgb, Secretogranin-1, mousemouse

Predictions only

Length 677 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChgbP16014 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ChgbP16014 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ChgbP16014 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ChgbP16014 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ChgbP16014 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ChgbP16014 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ChgbP16014 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC15.06■□□□□ 0
ChgbP16014 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ChgbP16014 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ChgbP16014 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ChgbP16014 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC15.06■□□□□ 0
ChgbP16014 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC15.06■□□□□ 0
ChgbP16014 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ChgbP16014 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ChgbP16014 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ChgbP16014 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ChgbP16014 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ChgbP16014 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ChgbP16014 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ChgbP16014 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ChgbP16014 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ChgbP16014 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ChgbP16014 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ChgbP16014 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ChgbP16014 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ChgbP16014 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ChgbP16014 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ChgbP16014 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ChgbP16014 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ChgbP16014 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ChgbP16014 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ChgbP16014 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ChgbP16014 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ChgbP16014 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ChgbP16014 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
ChgbP16014 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ChgbP16014 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ChgbP16014 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
ChgbP16014 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ 0
ChgbP16014 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
ChgbP16014 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ChgbP16014 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ChgbP16014 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ChgbP16014 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ChgbP16014 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC15.05■□□□□ -0
ChgbP16014 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ChgbP16014 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ChgbP16014 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
ChgbP16014 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC15.05■□□□□ -0
ChgbP16014 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ChgbP16014 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ChgbP16014 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ChgbP16014 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ChgbP16014 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ChgbP16014 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ChgbP16014 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ChgbP16014 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ChgbP16014 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ChgbP16014 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ChgbP16014 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ChgbP16014 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ChgbP16014 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ChgbP16014 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
ChgbP16014 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
ChgbP16014 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ChgbP16014 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ChgbP16014 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
ChgbP16014 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ChgbP16014 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ChgbP16014 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ChgbP16014 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ChgbP16014 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ChgbP16014 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ChgbP16014 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ChgbP16014 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ChgbP16014 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
ChgbP16014 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ChgbP16014 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
ChgbP16014 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ChgbP16014 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ChgbP16014 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ChgbP16014 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ChgbP16014 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC15.04■□□□□ -0
ChgbP16014 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
ChgbP16014 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ChgbP16014 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ChgbP16014 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ChgbP16014 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
ChgbP16014 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ChgbP16014 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ChgbP16014 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ChgbP16014 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ChgbP16014 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC15.04■□□□□ -0
ChgbP16014 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ChgbP16014 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ChgbP16014 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ChgbP16014 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ChgbP16014 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ChgbP16014 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ChgbP16014 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.8 ms