Protein–RNA interactions for Protein: P15331

Prph, Peripherin, mousemouse

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrphP15331 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PrphP15331 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
PrphP15331 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
PrphP15331 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PrphP15331 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PrphP15331 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PrphP15331 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PrphP15331 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PrphP15331 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PrphP15331 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PrphP15331 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PrphP15331 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PrphP15331 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PrphP15331 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PrphP15331 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PrphP15331 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PrphP15331 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PrphP15331 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PrphP15331 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PrphP15331 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PrphP15331 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PrphP15331 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PrphP15331 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PrphP15331 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PrphP15331 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PrphP15331 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PrphP15331 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
PrphP15331 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
PrphP15331 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PrphP15331 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PrphP15331 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PrphP15331 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PrphP15331 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PrphP15331 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PrphP15331 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PrphP15331 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PrphP15331 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PrphP15331 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
PrphP15331 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PrphP15331 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PrphP15331 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PrphP15331 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PrphP15331 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PrphP15331 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PrphP15331 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PrphP15331 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PrphP15331 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
PrphP15331 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PrphP15331 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PrphP15331 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PrphP15331 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PrphP15331 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PrphP15331 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PrphP15331 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PrphP15331 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PrphP15331 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PrphP15331 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PrphP15331 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PrphP15331 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PrphP15331 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PrphP15331 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
PrphP15331 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PrphP15331 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PrphP15331 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PrphP15331 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PrphP15331 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PrphP15331 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PrphP15331 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PrphP15331 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PrphP15331 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PrphP15331 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
PrphP15331 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
PrphP15331 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
PrphP15331 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
PrphP15331 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
PrphP15331 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
PrphP15331 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
PrphP15331 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
PrphP15331 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
PrphP15331 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
PrphP15331 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PrphP15331 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PrphP15331 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PrphP15331 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PrphP15331 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PrphP15331 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PrphP15331 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PrphP15331 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PrphP15331 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PrphP15331 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PrphP15331 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PrphP15331 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PrphP15331 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PrphP15331 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PrphP15331 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PrphP15331 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PrphP15331 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PrphP15331 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PrphP15331 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
PrphP15331 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms