Protein–RNA interactions for Protein: P10628

Hoxd4, Homeobox protein Hox-D4, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd4P10628 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hoxd4P10628 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hoxd4P10628 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Hoxd4P10628 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hoxd4P10628 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hoxd4P10628 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hoxd4P10628 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hoxd4P10628 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hoxd4P10628 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hoxd4P10628 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hoxd4P10628 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hoxd4P10628 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hoxd4P10628 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hoxd4P10628 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hoxd4P10628 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hoxd4P10628 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Hoxd4P10628 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hoxd4P10628 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hoxd4P10628 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hoxd4P10628 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hoxd4P10628 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hoxd4P10628 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hoxd4P10628 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hoxd4P10628 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hoxd4P10628 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hoxd4P10628 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hoxd4P10628 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hoxd4P10628 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
Hoxd4P10628 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxd4P10628 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxd4P10628 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxd4P10628 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxd4P10628 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxd4P10628 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxd4P10628 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxd4P10628 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxd4P10628 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxd4P10628 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxd4P10628 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxd4P10628 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxd4P10628 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxd4P10628 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxd4P10628 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxd4P10628 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxd4P10628 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxd4P10628 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxd4P10628 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxd4P10628 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxd4P10628 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxd4P10628 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxd4P10628 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxd4P10628 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxd4P10628 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxd4P10628 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxd4P10628 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxd4P10628 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxd4P10628 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxd4P10628 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxd4P10628 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxd4P10628 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxd4P10628 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxd4P10628 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxd4P10628 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxd4P10628 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxd4P10628 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxd4P10628 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxd4P10628 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxd4P10628 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxd4P10628 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxd4P10628 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxd4P10628 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxd4P10628 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxd4P10628 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxd4P10628 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxd4P10628 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxd4P10628 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxd4P10628 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxd4P10628 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxd4P10628 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxd4P10628 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxd4P10628 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxd4P10628 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxd4P10628 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxd4P10628 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxd4P10628 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxd4P10628 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hoxd4P10628 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hoxd4P10628 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hoxd4P10628 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hoxd4P10628 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hoxd4P10628 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hoxd4P10628 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hoxd4P10628 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hoxd4P10628 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hoxd4P10628 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hoxd4P10628 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hoxd4P10628 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hoxd4P10628 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hoxd4P10628 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hoxd4P10628 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms