Protein–RNA interactions for Protein: P0DP43

Catspere, Cation channel sperm-associated protein subunit epsilon, mousemouse

Predictions only

Length 985 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CatspereP0DP43 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CatspereP0DP43 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CatspereP0DP43 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CatspereP0DP43 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CatspereP0DP43 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CatspereP0DP43 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CatspereP0DP43 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CatspereP0DP43 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CatspereP0DP43 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CatspereP0DP43 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CatspereP0DP43 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CatspereP0DP43 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CatspereP0DP43 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CatspereP0DP43 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CatspereP0DP43 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CatspereP0DP43 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CatspereP0DP43 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CatspereP0DP43 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CatspereP0DP43 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CatspereP0DP43 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CatspereP0DP43 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CatspereP0DP43 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CatspereP0DP43 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CatspereP0DP43 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CatspereP0DP43 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CatspereP0DP43 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CatspereP0DP43 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CatspereP0DP43 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CatspereP0DP43 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CatspereP0DP43 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CatspereP0DP43 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CatspereP0DP43 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CatspereP0DP43 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CatspereP0DP43 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CatspereP0DP43 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CatspereP0DP43 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CatspereP0DP43 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CatspereP0DP43 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CatspereP0DP43 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CatspereP0DP43 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CatspereP0DP43 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CatspereP0DP43 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CatspereP0DP43 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CatspereP0DP43 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CatspereP0DP43 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CatspereP0DP43 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CatspereP0DP43 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CatspereP0DP43 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CatspereP0DP43 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CatspereP0DP43 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CatspereP0DP43 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CatspereP0DP43 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CatspereP0DP43 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CatspereP0DP43 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CatspereP0DP43 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CatspereP0DP43 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CatspereP0DP43 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CatspereP0DP43 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CatspereP0DP43 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CatspereP0DP43 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CatspereP0DP43 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CatspereP0DP43 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CatspereP0DP43 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CatspereP0DP43 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CatspereP0DP43 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CatspereP0DP43 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CatspereP0DP43 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CatspereP0DP43 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CatspereP0DP43 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CatspereP0DP43 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CatspereP0DP43 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CatspereP0DP43 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CatspereP0DP43 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CatspereP0DP43 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CatspereP0DP43 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CatspereP0DP43 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CatspereP0DP43 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CatspereP0DP43 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CatspereP0DP43 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CatspereP0DP43 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CatspereP0DP43 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CatspereP0DP43 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CatspereP0DP43 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CatspereP0DP43 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CatspereP0DP43 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CatspereP0DP43 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CatspereP0DP43 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CatspereP0DP43 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CatspereP0DP43 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CatspereP0DP43 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CatspereP0DP43 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
CatspereP0DP43 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
CatspereP0DP43 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
CatspereP0DP43 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
CatspereP0DP43 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.34
CatspereP0DP43 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CatspereP0DP43 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CatspereP0DP43 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CatspereP0DP43 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CatspereP0DP43 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms