Protein–RNA interactions for Protein: P0DMN7

Amd1, S-adenosylmethionine decarboxylase proenzyme 1, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Amd1P0DMN7 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Amd1P0DMN7 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Amd1P0DMN7 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Amd1P0DMN7 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Amd1P0DMN7 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Amd1P0DMN7 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Amd1P0DMN7 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Amd1P0DMN7 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Amd1P0DMN7 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Amd1P0DMN7 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Amd1P0DMN7 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Amd1P0DMN7 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Amd1P0DMN7 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Amd1P0DMN7 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Amd1P0DMN7 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Amd1P0DMN7 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Amd1P0DMN7 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Amd1P0DMN7 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Amd1P0DMN7 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Amd1P0DMN7 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Amd1P0DMN7 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Amd1P0DMN7 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Amd1P0DMN7 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Amd1P0DMN7 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Amd1P0DMN7 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Amd1P0DMN7 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Amd1P0DMN7 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Amd1P0DMN7 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Amd1P0DMN7 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Amd1P0DMN7 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Amd1P0DMN7 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Amd1P0DMN7 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Amd1P0DMN7 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Amd1P0DMN7 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Amd1P0DMN7 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Amd1P0DMN7 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Amd1P0DMN7 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Amd1P0DMN7 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Amd1P0DMN7 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Amd1P0DMN7 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Amd1P0DMN7 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Amd1P0DMN7 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Amd1P0DMN7 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Amd1P0DMN7 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Amd1P0DMN7 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Amd1P0DMN7 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Amd1P0DMN7 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Amd1P0DMN7 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Amd1P0DMN7 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Amd1P0DMN7 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Amd1P0DMN7 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Amd1P0DMN7 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Amd1P0DMN7 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Amd1P0DMN7 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Amd1P0DMN7 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Amd1P0DMN7 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Amd1P0DMN7 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Amd1P0DMN7 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
Amd1P0DMN7 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Amd1P0DMN7 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Amd1P0DMN7 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Amd1P0DMN7 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Amd1P0DMN7 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Amd1P0DMN7 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
Amd1P0DMN7 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Amd1P0DMN7 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Amd1P0DMN7 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Amd1P0DMN7 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Amd1P0DMN7 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Amd1P0DMN7 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Amd1P0DMN7 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Amd1P0DMN7 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Amd1P0DMN7 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Amd1P0DMN7 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Amd1P0DMN7 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Amd1P0DMN7 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Amd1P0DMN7 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Amd1P0DMN7 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Amd1P0DMN7 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Amd1P0DMN7 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Amd1P0DMN7 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Amd1P0DMN7 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Amd1P0DMN7 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Amd1P0DMN7 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Amd1P0DMN7 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Amd1P0DMN7 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Amd1P0DMN7 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Amd1P0DMN7 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Amd1P0DMN7 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Amd1P0DMN7 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Amd1P0DMN7 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Amd1P0DMN7 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Amd1P0DMN7 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Amd1P0DMN7 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Amd1P0DMN7 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Amd1P0DMN7 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Amd1P0DMN7 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Amd1P0DMN7 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Amd1P0DMN7 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Amd1P0DMN7 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.7 ms