Protein–RNA interactions for Protein: P09025

Hoxc8, Homeobox protein Hox-C8, mousemouse

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc8P09025 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hoxc8P09025 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hoxc8P09025 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hoxc8P09025 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hoxc8P09025 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hoxc8P09025 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hoxc8P09025 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hoxc8P09025 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hoxc8P09025 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hoxc8P09025 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hoxc8P09025 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hoxc8P09025 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hoxc8P09025 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hoxc8P09025 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hoxc8P09025 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hoxc8P09025 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hoxc8P09025 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hoxc8P09025 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hoxc8P09025 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hoxc8P09025 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hoxc8P09025 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hoxc8P09025 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hoxc8P09025 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hoxc8P09025 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hoxc8P09025 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hoxc8P09025 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hoxc8P09025 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hoxc8P09025 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hoxc8P09025 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hoxc8P09025 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hoxc8P09025 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hoxc8P09025 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Hoxc8P09025 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Hoxc8P09025 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hoxc8P09025 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hoxc8P09025 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hoxc8P09025 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hoxc8P09025 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hoxc8P09025 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hoxc8P09025 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hoxc8P09025 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hoxc8P09025 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hoxc8P09025 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hoxc8P09025 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hoxc8P09025 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hoxc8P09025 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hoxc8P09025 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Hoxc8P09025 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Hoxc8P09025 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Hoxc8P09025 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Hoxc8P09025 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Hoxc8P09025 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Hoxc8P09025 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hoxc8P09025 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hoxc8P09025 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Hoxc8P09025 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hoxc8P09025 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hoxc8P09025 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hoxc8P09025 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hoxc8P09025 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hoxc8P09025 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hoxc8P09025 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hoxc8P09025 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hoxc8P09025 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hoxc8P09025 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hoxc8P09025 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hoxc8P09025 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hoxc8P09025 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Hoxc8P09025 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hoxc8P09025 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hoxc8P09025 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hoxc8P09025 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hoxc8P09025 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hoxc8P09025 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hoxc8P09025 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hoxc8P09025 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hoxc8P09025 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hoxc8P09025 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hoxc8P09025 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hoxc8P09025 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Hoxc8P09025 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Hoxc8P09025 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Hoxc8P09025 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Hoxc8P09025 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hoxc8P09025 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hoxc8P09025 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hoxc8P09025 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Hoxc8P09025 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hoxc8P09025 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hoxc8P09025 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hoxc8P09025 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hoxc8P09025 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hoxc8P09025 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hoxc8P09025 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hoxc8P09025 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hoxc8P09025 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hoxc8P09025 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hoxc8P09025 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hoxc8P09025 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hoxc8P09025 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37 ms