Protein–RNA interactions for Protein: P09021

Hoxa5, Homeobox protein Hox-A5, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa5P09021 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Hoxa5P09021 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Hoxa5P09021 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Hoxa5P09021 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Hoxa5P09021 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Hoxa5P09021 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Hoxa5P09021 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Hoxa5P09021 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Hoxa5P09021 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Hoxa5P09021 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Hoxa5P09021 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Hoxa5P09021 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Hoxa5P09021 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Hoxa5P09021 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Hoxa5P09021 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Hoxa5P09021 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Hoxa5P09021 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Hoxa5P09021 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Hoxa5P09021 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Hoxa5P09021 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Hoxa5P09021 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Hoxa5P09021 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Hoxa5P09021 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Hoxa5P09021 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Hoxa5P09021 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Hoxa5P09021 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Hoxa5P09021 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Hoxa5P09021 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Hoxa5P09021 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Hoxa5P09021 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Hoxa5P09021 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Hoxa5P09021 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Hoxa5P09021 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Hoxa5P09021 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Hoxa5P09021 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Hoxa5P09021 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Hoxa5P09021 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Hoxa5P09021 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Hoxa5P09021 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Hoxa5P09021 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Hoxa5P09021 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Hoxa5P09021 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Hoxa5P09021 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Hoxa5P09021 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Hoxa5P09021 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Hoxa5P09021 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Hoxa5P09021 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Hoxa5P09021 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Hoxa5P09021 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Hoxa5P09021 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Hoxa5P09021 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Hoxa5P09021 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Hoxa5P09021 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Hoxa5P09021 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Hoxa5P09021 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Hoxa5P09021 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Hoxa5P09021 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Hoxa5P09021 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Hoxa5P09021 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Hoxa5P09021 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Hoxa5P09021 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Hoxa5P09021 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Hoxa5P09021 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Hoxa5P09021 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Hoxa5P09021 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Hoxa5P09021 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Hoxa5P09021 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Hoxa5P09021 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Hoxa5P09021 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Hoxa5P09021 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Hoxa5P09021 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Hoxa5P09021 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Hoxa5P09021 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Hoxa5P09021 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Hoxa5P09021 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Hoxa5P09021 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Hoxa5P09021 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Hoxa5P09021 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Hoxa5P09021 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Hoxa5P09021 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Hoxa5P09021 Gm42790-201ENSMUST00000201268 969 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Hoxa5P09021 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Hoxa5P09021 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Hoxa5P09021 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Hoxa5P09021 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Hoxa5P09021 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Hoxa5P09021 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Hoxa5P09021 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Hoxa5P09021 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Hoxa5P09021 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Hoxa5P09021 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Hoxa5P09021 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Hoxa5P09021 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Hoxa5P09021 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Hoxa5P09021 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Hoxa5P09021 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Hoxa5P09021 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Hoxa5P09021 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Hoxa5P09021 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Hoxa5P09021 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms