Protein–RNA interactions for Protein: P07214

Sparc, SPARC, mousemouse

Predictions only

Length 302 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SparcP07214 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SparcP07214 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
SparcP07214 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
SparcP07214 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SparcP07214 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SparcP07214 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SparcP07214 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SparcP07214 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SparcP07214 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SparcP07214 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SparcP07214 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SparcP07214 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SparcP07214 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SparcP07214 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SparcP07214 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SparcP07214 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SparcP07214 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SparcP07214 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SparcP07214 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SparcP07214 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SparcP07214 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SparcP07214 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
SparcP07214 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SparcP07214 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SparcP07214 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SparcP07214 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SparcP07214 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SparcP07214 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SparcP07214 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SparcP07214 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SparcP07214 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SparcP07214 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
SparcP07214 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
SparcP07214 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
SparcP07214 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SparcP07214 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SparcP07214 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SparcP07214 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SparcP07214 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
SparcP07214 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SparcP07214 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SparcP07214 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SparcP07214 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SparcP07214 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SparcP07214 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SparcP07214 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SparcP07214 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SparcP07214 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SparcP07214 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SparcP07214 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SparcP07214 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SparcP07214 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SparcP07214 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SparcP07214 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
SparcP07214 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SparcP07214 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SparcP07214 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SparcP07214 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SparcP07214 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SparcP07214 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SparcP07214 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SparcP07214 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SparcP07214 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SparcP07214 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SparcP07214 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SparcP07214 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SparcP07214 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SparcP07214 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SparcP07214 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SparcP07214 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SparcP07214 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
SparcP07214 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SparcP07214 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
SparcP07214 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SparcP07214 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SparcP07214 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SparcP07214 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SparcP07214 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SparcP07214 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SparcP07214 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SparcP07214 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SparcP07214 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SparcP07214 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SparcP07214 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SparcP07214 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SparcP07214 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SparcP07214 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SparcP07214 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SparcP07214 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SparcP07214 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SparcP07214 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SparcP07214 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SparcP07214 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SparcP07214 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SparcP07214 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SparcP07214 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SparcP07214 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SparcP07214 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SparcP07214 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SparcP07214 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.5 ms