Protein–RNA interactions for Protein: P04213

T-cell receptor beta chain V region C5 (Fragment), mousemouse

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Length 122 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P04213 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P04213 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P04213 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P04213 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P04213 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
P04213 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
P04213 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P04213 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
P04213 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
P04213 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
P04213 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
P04213 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
P04213 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
P04213 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
P04213 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P04213 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P04213 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
P04213 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
P04213 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P04213 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P04213 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P04213 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
P04213 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P04213 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
P04213 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P04213 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
P04213 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P04213 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P04213 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P04213 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
P04213 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
P04213 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
P04213 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P04213 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
P04213 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P04213 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
P04213 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P04213 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
P04213 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P04213 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P04213 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P04213 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
P04213 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
P04213 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
P04213 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P04213 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
P04213 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P04213 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
P04213 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P04213 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P04213 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P04213 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P04213 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
P04213 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P04213 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
P04213 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
P04213 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
P04213 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
P04213 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
P04213 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
P04213 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
P04213 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
P04213 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
P04213 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
P04213 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
P04213 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
P04213 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
P04213 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
P04213 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
P04213 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
P04213 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
P04213 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
P04213 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
P04213 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
P04213 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
P04213 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
P04213 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
P04213 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
P04213 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
P04213 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
P04213 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
P04213 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
P04213 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
P04213 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
P04213 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
P04213 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
P04213 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
P04213 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
P04213 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
P04213 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
P04213 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
P04213 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
P04213 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
P04213 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
P04213 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
P04213 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
P04213 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
P04213 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
P04213 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
P04213 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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