Protein–RNA interactions for Protein: P01648

Ig kappa chain V-V region HP 91A3, mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01648 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
P01648 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01648 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
P01648 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01648 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01648 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01648 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01648 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01648 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01648 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01648 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
P01648 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
P01648 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
P01648 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
P01648 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
P01648 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
P01648 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
P01648 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
P01648 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
P01648 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
P01648 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
P01648 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
P01648 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
P01648 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
P01648 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
P01648 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
P01648 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
P01648 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
P01648 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
P01648 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
P01648 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
P01648 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
P01648 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
P01648 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
P01648 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
P01648 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
P01648 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
P01648 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
P01648 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
P01648 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
P01648 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
P01648 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
P01648 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
P01648 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
P01648 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
P01648 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
P01648 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
P01648 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
P01648 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01648 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01648 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01648 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
P01648 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01648 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01648 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01648 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
P01648 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
P01648 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01648 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01648 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01648 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01648 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01648 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01648 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01648 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01648 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01648 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01648 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01648 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01648 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01648 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01648 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01648 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01648 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01648 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01648 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01648 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01648 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01648 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01648 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01648 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01648 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01648 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01648 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01648 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01648 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01648 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
P01648 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01648 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
P01648 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01648 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01648 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
P01648 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01648 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01648 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01648 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01648 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01648 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01648 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01648 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms